Revista internacional de minería de datos biomédicos
Acceso abierto
ISSN: 2090-4924
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Poersch A
La investigación del proteoma del líquido corporal humano se ha convertido en una de las metodologías más alentadoras para la detección de biomarcadores de enfermedades humanas, y la investigación de contrastes entre insultos y ejemplos generosos puede proporcionar datos significativos sobre la enfermedad. El objetivo de esta investigación es reconocer, medir y agrupar proteínas presentes en grupos de líquidos de tumores epiteliales de ovario difamatorios (n=10) y de líquidos de tumores epiteliales de ovario favorables (n=10). Los pools fueron expuestos a inmunodepleción de clara de huevo e IgG, denominación isotópica con acrilamida, desprendimiento por SDS-PAGE y asimilación in situ con tripsina. Todos los péptidos trípticos se aislaron mediante cromatografía de fluidos.comercio seguido de una etapa de giro acoplada a un espectrómetro de masas LTQ-ORBITRAP (LC-MS/MS). Reconocemos 386 proteínas básicas en los dos grupos, 505 proteínas identificadas claramente en el grupo censurado y 272 proteínas identificadas únicamente en el grupo amable. Entre las proteínas distinguidas (1100 aproximadamente), 366 indicaron una evaluación relativa dependiente del marcado isotópico. Las proteínas que se sabe que son pertinentes para la malignidad se reconocieron diferencialmente recolectadas entre los grupos, incluida la mucina (CA125), LCN2 (Lipocalin-2), WFDC2 (HE4), entre otras. Además, las proteínas identificadas se mencionaron en el escrito como contendientes para biomarcadores.o proteínas de enfermedades ováricas ampliamente examinadas, como SPP1 (osteopontina), MSLN (mesotelina), TTR (transtiretina), APOA1 (apolipoproteína AI) e IGFBP2 (proteína 2 restrictiva del factor de desarrollo similar a la insulina). En este sentido, los ejemplos son ricos en separar las fases de la dolencia y el examen del líquido tumoral reconoce una enorme cantidad de proteínas normales para tumores malignos, con potencial para su uso como marcadores tumorales o como posibles focos terapéuticos.
El crecimiento maligno de ovario es una de las enfermedades epiteliales más contundentes y mortales en las mujeres. Hay cuatro tipos histológicos significativos de malignidad epitelial de ovario: seroso, endometrioide, de células claras y mucinoso, que contrastan tanto en su conducta clínica como en sus cualidades atómicas. El subtipo seroso es el más analizado y responsable de la mayoría de los casos de enfermedades ováricas. En este momento no existe una prueba analítica no obstructiva precisa para el crecimiento maligno de ovario; la mayoría de los pacientes se analizan en una etapa propulsada, dando metástasis e intrusión del orificio peritoneal y ascitis. De esta manera, la evidencia reconocible de las proteínas que se comunican generosa y trascendentemente en la neoplasia maligna de ovariopresenta un esfuerzo importante y puede brindar información temprana sobre la proximidad de la enfermedad ovárica, así como signos de un subtipo atómico que podría ayudar a dirigir el tratamiento.
La evidencia reconocible de la colección de proteínas que se separan de la superficie celular y de las proteínas que, de todos modos, se descargan en el compartimento extracelular puede contribuir a nuestra comprensión de la conducta del tumor, a la identificación de posibles marcadores demostrativos perceptibles disponibles para su uso y de posibles imágenes y focos útiles en los restos que se muestran en la superficie de la célula. Durante la metástasis de una neoplasia maligna de ovario, la creación de proteinasas que corrompen el marco por parte de las células tumorales se suma a la interrupción de las asociaciones celulares a través de un sistema de desprendimiento de partículas de unión. Estos sistemas se han exhibido en entornos de enfermedades ováricas para ALCAM y para cadherina epitelial (CDH1).
Por dentro y por fuera, la proteómica cuantitativa permite este esquema de proteínas comunicadas en células tumorales y en compartimentos subcelulares. Algunos estudios proteómicos han descompuesto el tejido tumoral de ovario, las líneas celulares, el líquido de ascitis y la sangre de pacientes con cáncer de ovario. En cualquier caso, todavía existe la necesidad de retratar y analizar metódicamente conjuntos de proteínas cuyas áreas las hacen particularmente pertinentes para la determinación y el tratamiento, ya sean proteínas en la superficie del teléfono o aquellas descargadas en el medio extracelular, y decidir el sistema. y elementos de la descarga proteica en el espacio extracelular.
Retratamos tres líneas celulares de adenocarcinoma de ovario, OVCAR3, CaOV3 y ES2, así como células de cáncer de ovario mejoradas a partir del líquido de ascitis con un estudio proteómico de arriba a abajo de lisados celulares completos, el proteoma de la superficie celular y las proteínas descargadas en el compartimento extracelular. investigación detalladade la información descubrió algunas maravillas naturales intrigantes, que incluyen un amplio desprendimiento de espacios extracelulares para proteínas comunicadas en la superficie celular y altos ritmos de emisión de un subconjunto de proteínas. La información también incorpora varios marcadores de proteínas que se sabe que están relacionados con la enfermedad ovárica. El siguiente conjunto de datos abiertos es un activo para la revelación de objetivos indicativos y útiles y una rica fuente de datos sobre la circulación de proteínas entre el interior del teléfono, la superficie del teléfono y el espacio extracelular.
Las células OVCAR3, CaOV3 y ES2 se desarrollaron en medios DMEM (Invitrogen) que contenían 0,1 % de suero fetal de vaca (FBS) dializado (Invitrogen) y 13C-lisina en lugar de lisina normal, para 7 entradas (1