Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Perfil de localización subcelular de proteínas de células prostáticas por disociable Tecnología de tinción MicroArray de anticuerpos (DAMA)

Guanyuan Fu, X Cynthia Song, Xufen Yang, Yi Mo y G Wayne Zhou

Antecedentes: La tecnología de tinción MicroArray de anticuerpos disociables (DAMA) es un nuevo enfoque para el análisis global de la expresión de proteínas y los perfiles de localización subcelular en células fijadas. Hemos desarrollado la tecnología y demostrado su aplicación en la identificación de proteínas expresadas diferencialmente en células de cáncer de mama. Determinamos los perfiles de localización subcelular de 360 proteínas en células de mama e identificamos una proteína con localización subcelular única en células de cáncer de mama, mediante la combinación de datos de cuatro matrices de formato de 96 anticuerpos. En este informe, hemos desarrollado aún más la tecnología para determinar los perfiles de localización subcelular de 400 proteínas simultáneamente desde un solo chip, en un formato de 400 anticuerpos.

Método: hemos determinado los perfiles de localización subcelular de 400 anticuerpos dispuestos en dos líneas celulares de próstata normal (PWR-1E y PZ-HPV-7) y tres líneas celulares de cáncer (Du145, LNCap y VCap). Los perfiles de localización subcelular fueron comparados y analizados por Chipview, el programa para la gestión y análisis de bases de datos de imágenes.

Resultados: se identificó que una proteína, GRK2, tiene una localización única en algunas de las células cancerosas: localizada en la membrana de dos líneas celulares cancerosas y en el citosol de líneas celulares normales y una línea celular cancerosa. La diferencia de localización subcelular identificada se confirmó mediante inmunotinción individual.

Conclusión: la tecnología de tinción DAMA podría ser un método poderoso para la creación de perfiles de localización subcelular global en formato de alto rendimiento.