Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Marcadores de proteínas asociados con una subpoblación de ALDH en colorrectal Cáncer

Rui Yang, Xinhua Liu, Smathorn Thakolwiboon, Jianhui Zhu, Xiucong Pei, Mingrui An, Zhijing Tan y David M Lubman

Se ha demostrado que la ALDH es un marcador que denota una subpoblación de células madre cancerosas en el cáncer colorrectal y otros tipos de cáncer. Esta subpoblación de células muestra un mayor riesgo de iniciación tumoral, metástasis y resistencia a la quimioterapia y la radiación, lo que da como resultado la recurrencia y la muerte. Por lo tanto, es esencial identificar las vías de señalización importantes relacionadas con las CSC ALDH1+ en el cáncer de colon. La cuestión esencial se convierte en aislar subpoblaciones puras de células de tejidos heterogéneos para su posterior análisis. Para lograr este objetivo, los tejidos de pacientes con cáncer colorrectal en estadio III se inmunoteñeron con el anticuerpo ALDH1. Las células objetivo ALDH1+ y ALDH1- del mismo tejido se microdiseccionaron usando microdisección por captura láser (LCM). Las células capturadas se lisaron y analizaron utilizando LC-MS/MS, donde estaban disponibles alrededor de 20.000 células para el análisis. Este análisis dio como resultado 134 proteínas que se expresaron de manera diferencial entre las células ALDH1+ y ALDH1- en tres pares de muestras de pacientes. Sobre la base de estas proteínas expresadas diferencialmente, se realizó un análisis de la vía IPA que mostró dos vías clave en la señalización de célula a célula y en las lesiones y anomalías del organismo. El análisis IPA reveló β-catenina, NFkappa;B (p65) y TGFβ1 como importantes proteínas relacionadas con el cáncer en estas vías. Se usó una validación de TMA usando tinción de inmunofluorescencia de micromatrices de tejido que incluye 170 casos para verificar que estas proteínas clave estaban altamente sobreexpresadas en células ALDH1+ en tejidos de cáncer de colon en comparación con las células ALDH1-.