Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Investigaciones preliminares sobre las interacciones de unión entre las proteínas del huésped y del plasmodio utilizando enfoques computacionales

Norbert Nwankwo y Huseyin Seker

Los científicos posgenómicos se quedan con un gran depósito de información genómica y proteómica, como péptidos y residuos de proteínas para su análisis. Por ejemplo, se ha reconocido que una especie de Plasmodium llamada falciparum tiene más de 4.600 péptidos que se ensamblan en más de 700 proteínas, y se ha identificado que el genoma humano posee hasta 20.000-25.000 genes que codifican proteínas. Estas proteínas y péptidos, adquiridos como resultado de mutaciones, requieren una reevaluación constante para diseñar intervenciones terapéuticas y mejorar nuestro bienestar. Los enfoques clínicos para evaluar estos vastos datos son costosos, consumen recursos y tiempo, son laboriosos y arduos. Como resultado, los enfoques computacionales se han vuelto necesarios, ya que agilizarán, reestrategiarán y racionalizarán los procedimientos preliminares de evaluación clínica que se están empleando en la búsqueda de medicamentos y vacunas. En este estudio, Plasmodial y sus proteínas objetivo del huésped se estudian para averiguar si existe una correlación entre los hallazgos clínicos establecidos y nuestros resultados computacionales. En este estudio se reveló que algunos resultados obtenidos computacionalmente se correlacionaron con hallazgos clínicos. Por ejemplo, se encuentra que el dominio adhesivo del Circumsporozoite (CSP) y la Importina alfa 3, cuya interacción se ha verificado clínicamente, comparten la misma frecuencia de consenso computacionalmente. Por otro lado, algunos hallazgos preliminares no pudieron correlacionarse con nuestros resultados. Esto podría ser el resultado de las proteínas comprometidas. Por lo tanto, nuestros hallazgos parecen sugerir que las interacciones de unión se pueden establecer computacionalmente y también recomiendan que se involucren proteínas o péptidos precisos para obtener los resultados computacionales deseados.