Investigación inmunológica
Acceso abierto

abstracto

Predicción de vacunas basadas en péptidos múltiples a partir de proteínas E1, E2 y de la cápside del virus de la rubéola: un enfoque in-silico

Shaima Nasr Eldeen Mohamed Elgenaid, Ebrahim Mohammed Al-Hajj, Ahmed Abdulkarim Ibrahim, Mohammed Elmujtaba Adam Essa, Ahmed Hamdi Abu-haraz, Khoubieb Ali Abd-elrahman y Mohamed A Hassan

La rubéola es un virus de ARN monocatenario en estructura que pertenece a la familia Togaviridae. Provoca rubéola por transmisión de gotitas respiratorias y síndrome de rubéola congénita si se produce infección a la madre durante el embarazo. La vacuna atenuada de vida actual se administra como parte de la vacuna MMR. Tiene muchos efectos secundarios y está contraindicado en el embarazo y en personas inmunodeprimidas. El objetivo de este estudio es determinar los péptidos antigénicos de las proteínas E1, E2 y de la cápside que se pueden usar para el diseño de vacunas de péptidos múltiples mediante el estudio In-Silico. Se obtuvieron un total de 189 secuencias de tres proteínas de NCBI y se sometieron a múltiples alineaciones de secuencias utilizando la herramienta CLUSTALW para determinar las regiones conservadas. Las herramientas de la base de datos de epítopos inmunes se utilizaron para determinar los epítopos de células B, estas herramientas son la predicción de epítopos de células B lineales de Bepipred, la accesibilidad de la superficie y la predicción de antigenicidad. La unión de epítopos a MHC de clase I y clase II y su cobertura de población también se determinaron utilizando el software IEDB. Los resultados del análisis son los siguientes, para la unión de células B de E1 fueron (PVCQRHSP, QYHPTAC y QVPPD), de E2 (AQYPP, PAHP y TTAANSTTAATPATA) y (PPPP, PPQQPQPP y PPHT) de la proteína de la cápside. Todos estos péptidos tienen una alta puntuación en la predicción de epítopos de células B lineales, accesibilidad a la superficie y predicción de antigenicidad. Por otro lado, los péptidos que reaccionaron al MHC de clase I fueron (YFNPGGSYY, FVLLVPWVL y FTNLGTPPL) de la forma E1, E2 y la proteína de la cápside, respectivamente. Vale la pena señalar que el péptido FVLLVPWVL de la proteína E2 también se une al MHC de clase II con alta afinidad. Todos los péptidos de células T tenían la mayor cobertura de población y se encontró que la cobertura combinada para todos los péptidos en este estudio era del 100 %. El uso de estudios In-Silico garantizará un menor riesgo de virulencia y efectos secundarios. Se necesita la evaluación de la respuesta de anticuerpos en modelos animales para confirmar la eficacia de estos epítopos en la inducción de una respuesta inmunitaria protectora.