Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Predicción de la estructura tridimensional de la proteína catepsina L de rattus norvegicus

Sunil Kumar, Priya Ranjan Debata y Prakash C. Supakar

Cathepsin L es una cisteína proteasa que degrada las proteínas del tejido conectivo como el colágeno, la elastina y la fibronectina. Aumento de la expresión de catepsina L en el riñón anciano que conduce a una pérdida considerable de la función del órgano en la vejez. Recientemente se ha informado que los retrovirus pseudotipados de proteína de pico de SARS-CoV o SARS-CoV utilizan la actividad enzimática de la proteasa de catepsina L endosomal para la entrada viral. En este informe, se construyó una estructura 3D de la catepsina L de rata a través del modelado de homología utilizando la estructura de rayos X de la procatepsina L del Homo sapiens (código PDB: 1CS8). El modelado de homología se realizó utilizando el software MODELLER 9v2. El modelo final obtenido por el método de mecánica y dinámica molecular y fue evaluado por PROCHECK y VERIFY 3D graph, lo que mostró que el modelo refinado final es confiable. El modelo podría explorarse más a fondo para caracterizar la proteína.