Investigación inmunológica
Acceso abierto
ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Mawadda Abd-Elraheem Awad-Elkareem, Soada Ahmed Osman, Hanaa Abdalla Mohamed, Hadeel Abd-Elrahman Hassan, Ahmed Hamdi Abu-haraz, Khoubieb Ali Abd-elrahman y Mohamed Ahmed Salih
El poliomavirus de células de Merkel es un virus dsDNA sin envoltura que pertenece a la familia Polyomaviridae y está relacionado con una malignidad agresiva de la piel poco común. El mal pronóstico y la comprensión limitada de la patogenia de la enfermedad justifican un tratamiento innovador. En este estudio actual, nuestro objetivo es predecir epítopos inmunogénicos de células TB a partir de la proteína VP1 de todas las cepas de poliomavirus de células de Merkel, lo que ayudará en el diseño de vacunas basadas en epítopos efectivos utilizando enfoques inmunoinformáticos. Recuperamos 423 secuencias de proteína VP1 de longitud completa de especies de virus de poliomavirus de células de Merkel de la base de datos NCBI. Estas secuencias se analizaron para determinar la región conservada y se usaron para predecir los epítopos usando los algoritmos de inmunoinformática de IEDB. Para las células B, se predijeron tres epítopos como vacuna peptídica (QEKTVY, KTVYPK y QEKTVYP). Para las células T, se encontró que los péptidos de Clase I previstos (SLFSNLMPK, LQMWEAISV y LLVKGGVEV) cubrían el número máximo de alelos MHC I. Los péptidos de unión al MHC de clase II con la puntuación más alta fueron (IELYLNPRM, ISSLINVHY e INSLFSNLM). Será necesario realizar más experimentos para confirmar el potencial de estos epítopos predichos en el desarrollo de una vacuna eficaz en el futuro.