Revista de Antivirales y Antirretrovirales
Acceso abierto

abstracto

Polimorfismos en los genes de proteasa y transcriptasa inversa del subtipo C del VIH-1 en una cohorte de pacientes de Mumbai

Ritwik Dahake, Shraddha Mehta, Sneha Yadav, Abhay Chowdhary y Ranjana A Deshmukh

Objetivos: Los países desarrollados se han alarmado por las tasas de resistencia a los 1. Existe un debate sobre la validez de ciertos polimorfismos en las mutaciones del subtipo C del VIH-1 relacionadas con las secuencias consenso del subtipo B que se asocian y, a veces, se confunden con la resistencia primaria. En este estudio preliminar, hemos determinado polimorfismos en los genes de transcriptasa inversa (RT) y proteasa (PR) del subtipo C del VIH-1 de una cohorte de pacientes en Mumbai, India.

Métodos: El estudio se realizó con muestras de plasma de veinticuatro pacientes (tanto con experiencia en terapia antirretroviral como sin tratamiento previo con medicamentos) empleando un "brebaje casero"; PCR con transcriptasa inversa semianidada seguida de secuenciación y análisis de secuencias. La base de datos de farmacorresistencia del VIH de Stanford se utilizó para el análisis y la interpretación de polimorfismos y otras mutaciones de resistencia a los medicamentos. También analizamos las mutaciones de resistencia a fármacos de vigilancia (SDRM) para el gen PR.

Resultados: Se determinaron polimorfismos a una frecuencia mutacional de 0,1337 ± 0,042 en el gen PR y 0,067 ± 0,014 en el gen RT, mientras que el 16,6 % y el 12,5 % de las muestras albergaban mutaciones de resistencia a los fármacos en los genes PR y RT, respectivamente. Las sustituciones superiores al 50% estaban en las posiciones L19, V82, M36, R41, L63, H69, L89 e I93 para el gen PR y D121, K122, T165, K166, K173, D177, T200, Q207 y R211 para el gen RT. Además, se observaron SDRM del gen PR en el 15,0 % de las muestras.

Conclusiones: nuestros hallazgos coinciden con hallazgos anteriores de que existen polimorfismos en el subtipo C del VIH-1 de la India y reiteran que estos polimorfismos también pueden incluir una serie de mutaciones principales y secundarias/accesorias asociadas con la resistencia. La mayoría de las bases de datos de farmacorresistencia disponibles en línea se basan en el subtipo B; por lo tanto, recomendamos que se creen bases de datos de farmacorresistencia específicas del subtipo de VIH para potenciar la vigilancia rutinaria e inequívoca de la farmacorresistencia antes de iniciar la terapia antirretroviral, especialmente cuando se incluyen inhibidores de la proteasa.