Revista Global de Ciencias de la Vida e Investigación Biológica
Acceso abierto

ISSN: 2456-3102

abstracto

Plant Genomics 2019: El desarrollo de un nuevo ensayo de genotipado de SNP para diferenciar clones de cacao - Jocelyn De Wever - Universidad de Ghent

jocelyn de wever

Los estudios de diversidad genética de plantas son de gran importancia para una conversación de plantas eficiente y estrategias de recursos (por ejemplo, abordar el etiquetado incorrecto, conservando material genético valioso, análisis de parentesco y estudios de diversidad genética), ya que contribuyen a un mayor conocimiento sobre el trasfondo genético y la diversidad de plantas específicas. Estos estudios se analizan más comúnmente a través de métodos de genotipado simples y efectivos que utilizan marcadores genéticos, como SSR; sin embargo, los SNP están ganando más interés. Recientemente, se ha propuesto un método rentable basado en qPCR para fines de genotipado de SNP, denominado qPCR de alelo específico de doble desajuste (DMAS) como alternativa económica a                        -muestra y método multilocus, basado en la lectura directa de la tecnología qPCR basada en colorante de unión a ADN. Su diseño, optimización, validación y aplicación en Theobroma cacao L., un importante cultivo comercial involucrado en la producción de chocolate, ha resultado exitoso. Ofreció un conocimiento valioso sobre los antecedentes del cacao, que a menudo está plagado de errores de etiquetado y recursos de gestión ineficientes y limitados. El método, optimizado aquí, mostró una eficiencia del 98,05 % para identificar el genotipo de cacao correcto e identificó un 15,38 % de plantas fuera de tipo y dos duplicados en una población de cacao reconocida internacionalmente (n=65), utilizando una cantidad limitada de marcadores (n=42). Además, solo se necesitaron 13 marcadores para diferenciar todas las accesiones analizadas. En particular, el método descrito se puede optimizar e implementar fácilmente en cualquier laboratorio de biología molecular para una amplia gama de objetivos y organismos, p. detección de mutaciones y para facilitar el mapeo de genes y la selección asistida por marcadores con fines de reproducción.

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