Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto
ISSN: 0974-276X
ISSN: 0974-276X
Anastasia Mpakali, Andriana G. Kotini, Magda Spella, Marina Kouyialis, Angelliki Tserga, Leonidas Fragkos-Livanios, Martina Samiotaki y Theodora Agalioti
La genómica de 5-metil citosina (5meC) los patrones de metilación juegan un papel crucial en el desarrollo de los mamíferos y se alteran en el cáncer. Las enzimas que crean, mantienen y modifican los patrones de metilación del ADN son las ADN metiltransferasas (Dnmts), todas codificadas por genes esenciales. Los Dnmts de novo -Dnmt3a y Dnmt3b- establecen los patrones de metilación del ADN al principio del desarrollo de los mamíferos mediante la introducción de marcas de metilación del ADN donde no existe una metilación previa. Estas enzimas no muestran afinidad por secuencias de ADN específicas, por lo que su reclutamiento en loci de ADN específicos y sus actividades deben estar estrictamente regulados. En particular, Dnmt3a2, una de las dos isoformas de proteína producidas por el locus Dnmt3a, es la ADN metiltransferasa más abundante en las células madre embrionarias de ratón. Para identificar los reguladores de Dnmt3a (y la metilación del ADN), hemos buscado proteínas que interactúan con Dnmt3a2 en mESC mediante espectrometría de masas y desplegable. Se identificó que la helicasa de ARN p68/Ddx5 de la caja DEAD interactúa directamente con Dnmt3a1 y Dnmt3a2 in vitro e in vivo. Hemos creado una proteína mutante Ddx5 (Ddx5 MUT) que muestra un patrón de localización nuclear alterado en comparación con la proteína wt. Tanto el Ddx5 wt como el mutante interactúan directamente in vitro y colocalizan in vivo con las proteínas Dnmt3a. Nuestros datos sugieren que la interacción Dnmt3a/Ddx5 podría ser significativa para modular la dinámica de metilación/desmetilación del ADN in vivo.