Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Sobreexpresión de la proteína 3 asociada a la cinesina (KIFAP3) en el cáncer de mama

Deepthi Telikicherla, Jagadeesha Maharudraiah, Harsh Pawar, Arivusudar Marimuthu, Manoj Kumar Kashyap, Y. L. Ramachandra, Juan Carlos Roa y Akhilesh Pandey

Los estudios de perfiles de expresión génica en el cáncer de mama han generado catálogos de genes expresados diferencialmente. Sin embargo, muchos de estos genes no han sido investigados por su expresión a nivel de proteína. Es posible evaluar sistemáticamente tales genes de una manera de alto rendimiento para su sobreexpresión a nivel de proteína utilizando microarrays de tejido de cáncer de mama. Nuestra estrategia involucró la integración de información de repositorios de expresión génica disponibles públicamente para preparar una lista de genes regulados al alza a nivel de ARNm en cáncer de mama seguido de la curación de la literatura publicada para identificar aquellos genes que no fueron probados para sobreexpresión a nivel de proteína. Identificamos la proteína 3 asociada a la kinesina (KIFAP3) como una de esas moléculas para una mayor validación a nivel de proteína. El etiquetado inmunohistoquímico de KIFAP3 utilizando micromatrices de tejido de cáncer de mama reveló una sobreexpresión de la proteína KIFAP3 en el 84 % (240/285) de los cánceres de mama, lo que indica la utilidad de nuestro enfoque integrado de combinar el análisis computacional con la biología experimental.