Biología Sintética y de Sistemas Actual
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abstracto

Criterios de puntuación de plantillas no lineales y engañosas: Causa raíz de Inexactitudes en el modelado de proteínas

Ashish Runthala

El modelado de proteínas basado en plantillas es actualmente el método más preciso y confiable para predecir las conformaciones de proteínas correctas para cerrar la brecha cada vez mayor entre el número de estructuras de proteínas resueltas experimentalmente y el recuento de secuencias de proteínas. Nuestros mejores algoritmos de predicción basados en el conocimiento que emplean las plantillas no son muy competentes en la selección constante de las mejores plantillas de puntuación para construir un modelo de proteína de alta precisión. La naturaleza mutuamente opuesta de las puntuaciones de evaluación y selección de plantillas genéricas y actualmente empleadas hace que este paso de modelado esencial sea un negocio muy complicado y fortuito. Precisamente, el artículo investiga brevemente y justifica el impacto del grado de libertad fundamentalmente permitido de una medida de selección de plantilla en la precisión de los modelos de proteínas construidos. Varias pautas lógicas, normalmente pasadas por alto en una tarea de modelado de proteínas, se analizan y deben considerarse de forma rutinaria. Por lo tanto, se requiere obligatoriamente una medida de puntuación más confiable y sólida para seleccionar la mejor plantilla disponible posible para construir la conformación objetivo más precisa.