Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Nuevos conocimientos sobre los mecanismos moleculares de metales anticancerígenos seleccionados Compuestos a través del análisis bioinformático de datos proteómicos

Tania Gamberi, Francesca Magherini, Luca Bini, Luigi Messori, Chiara Gabbiani, Laura Pietrovito, Pietro Amedeo Modesti y Alessandra Modesti

La investigación se ha centrado cada vez más en los compuestos citotóxicos de oro y rutenio como candidatos a fármacos contra el cáncer. De las investigaciones proteómicas, surgió claramente que unas pocas vías celulares diferentes relevantes para la comprensión de las acciones farmacológicas están específicamente moduladas por ellos. Para obtener una mejor interpretación de sus efectos celulares, decidimos realizar un análisis bioinformático completo de los resultados proteómicos disponibles. Los datos obtenidos de los tratamientos publicados anteriormente se agruparon y mapearon en PPI Spider en el portal web Bioprofiling (http://www.BioProfiling.de/gene_list). Se elaboró un mapa preliminar de interacciones proteína-proteína y se destacaron algunas características mecánicamente relevantes. En total, 34 proteínas resultaron ser interactuadores directos de compuestos de oro y rutenio; construimos una red de interacción estadísticamente significativa que agrupaba todas las proteínas expresadas diferencialmente. Además, mostramos como proteína intermedia cREL un componente del NF-kappa-B. Este estudio explora las vías de las proteínas afectadas desde una perspectiva interactómica destacando la importancia del análisis bioinformático avanzado.