Enfermedades micobacterianas
Acceso abierto
ISSN: 2161-1068
ISSN: 2161-1068
Hana Elbadaui
Acinetobacter baumannii ha surgido como un importante organismo multirresistente asociado con infecciones nosocomiales en todo el mundo. Este estudio tuvo como objetivo explorar la epidemiología molecular y los mecanismos de resistencia a los antimicrobianos utilizando la secuenciación del genoma completo (WGS) de A. baumannii resistente a carbapenem (CRAb) aislado de pacientes en el estado de Jartum, Sudán. Se recolectaron veintidós CRAb no duplicados entre octubre de 2016 y febrero de 2017, de una variedad de muestras clínicas obtenidas de pacientes en dos hospitales en el estado de Jartum. La identificación de especies y los mecanismos de resistencia a los carbapenémicos se investigaron inicialmente utilizando métodos de detección fenotípica y PCR utilizando diferentes PCR multiplex para gyrB, grupo OXA (OXA-23, -40, -51, -58, -143 y -235) y multiplex interno. PCR para detectar genes que codifican NDM, IMP, VIM, GIM, KPC y GES. Los aislamientos se caracterizaron además por WGS (Illumina MiSeq) y se identificaron los caracteres epidemiológicos moleculares y los mecanismos de resistencia. Todos los aislamientos fueron fenotípicamente resistentes a los carbapenémicos y albergaron varios genes de β-lactamasa. El gen que codifica el OXA-23 adquirido se detectó en 21/22 (95 %) de los aislamientos, tres de los cuales co-albergaban OXA-58. Otras carbapenemasas detectadas fueron: NDM-1 4/22 (18%) y GES-11 2/22 (9%). TEM-1D se detectó en 20/22 (90%) aislamientos. Un aislado tenía ISAba1 aguas arriba de blaOXA-51, así como genes que codifican OXA-1 y CTX-M-15. Además, se detectaron muchos otros genes de resistencia adquiridos que confieren resistencia a aminoglucósidos, macrólidos, fluoroquinolonas, fenicoles, tetraciclinas, sulfonamidas y trimetoprima. 19/22 (86%) de los aislamientos se agruparon con IC2 y tenían el blaOXA-66 intrínseco. Dos aislamientos agrupados con diferentes IC albergaban los genes OXA intrínsecos: IC1 con blaOXA-69 e IC5 con blaOXA-91. El aislado esporádico tenía blaOXA-51. La tipificación molecular basada en cgMLST reveló dos grupos de transmisión que contenían aislamientos de dos hospitales, con 12 y 3 aislamientos. En conclusión, nuestros aislamientos de CRAb pertenecían principalmente a IC2 y constituyen un problema destacado en nuestro entorno local. Los aislados productores de OXA-23 frecuentemente poseen otros genes de resistencia que codifican NDM-1, GES-11 y OXA-58. Para la prevención, se debe mejorar la detección, la vigilancia y el control de infecciones.