Anestesia e Investigación Clínica
Acceso abierto

abstracto

Acoplamiento molecular y análisis de ligandos generados in silico contra proteínas de punta y replicasa de SARSCoV-2

Ifeanyichukwu Okeke*, Cosmas Okeke

A través del acoplamiento molecular, una biblioteca de ligandos generados in silico se acopló a SARS-CoV- 2 proteínas de pico y replicasa para identificar conductores con propensión a unirse a ellos con alta afinidad. Los conductores identificados demostraron unirse a estas proteínas con una afinidad más fuerte que el ligando nativo, ayudando en sus procesos metabólicos in vivo. Por lo que se observó que la proteína espiga se une a su receptor celular con una afinidad de unión de -4.8 Kcal/mol; se une a un análogo no celular con -5,4, mientras que 4twy 3BL y 5n19 D03 se unen a la proteína espiga con afinidades de unión de -7,3 Kcal/mol cada una. También se unen a la proteína replicasa con -8,2 y -7,2 Kcal/mol respectivamente. Los hallazgos indican que los ligandos identificados pueden desplazar o inhibir preferentemente la unión de las proteínas virales a sus ligandos endógenos nativos y que tanto la unión celular a través de la interacción de picos y ACE2 como el proceso de replicación viral pueden inhibirse usando solo una de las sustancias identificadas. A partir del estudio, 5c8s G3A y 2d2d ENB se identificaron como los conductores más adecuados que tienen una disposición favorable para la detección de la proteína del pico del SARS-CoV-2 a partir de muestras biológicas, mientras que 3d62 959 y 1r4l XX5 se identificaron como los conductores con la similitud farmacológica más adecuada contra el SARS -CoV-2 basado en los filtros de quimioinformática SwissADME y Molinspiration y, por lo tanto, merece más evaluaciones in vitro e in vivo.