Ayman Kamal El Ensayo
En 2017, la Organización Mundial de la Salud (OMS) clasificó a las Pseudomonas resistentes a los carbapenemes entre las bacterias multirresistentes más críticas para atencion urgente. En este estudio, se probaron el ensayo basado en micromatrices de nanoesferas verigene y la PCR multiplex para la detección de genes que codifican carbapenem. También se llevó a cabo la secuenciación del gen que codifica la carbapenemasa de la cepa original y su mutante UV seguido de alineaciones de la secuencia de nucleótidos. La resistencia bacteriana al carbapenem se probó después del curado inducido del plásmido mediante dodecilsulfato de sodio (SDS) y tratamiento térmico. Se detectó un conjunto de genes que incluyen IMP, VIM y SME en una reacción mediante PCR multiplex. Verigene-nanosphere detectó 3, 0, 0 entre 5, 4, 11 y cepas positivas previamente determinadas para los genes VIM, IMP, KPC respectivamente. La resistencia a los carbapenémicos se conservó después de tratar la cepa CRPA con calor o SDS. Las alineaciones de secuencias de nucleótidos de los genes VIM, IMP y KPC mostraron relación con muchas especies gram negativas. El gen VIM se perdió en el mutante UV y los genes IMP y KPC se conservaron, pero se produjo una modificación de secuencia del 1-2% sin cambios en la resistencia a imipenem y meropenem. En conclusión, la PCR multiplex desarrollada detectó con éxito un conjunto de genes codificadores de carbapenem, mientras que la nanoesfera verigene basada en micromatrices no pudo detectar la mayoría de los genes en las condiciones experimentales actuales. Los alineamientos de nucleótidos de los genes VIM, IMP y KPC revelaron que estas secuencias de genes se distribuyen entre especies de bacterias gram negativas. Los genes IMP y KPC se conservaron en el mutante UV sin daño, daño reparado o poca modificación de la secuencia de nucleótidos y, mientras tanto, se conservó la resistencia a los carbapenémicos.