Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Caracterización molecular y análisis filogenético de la proteína BZIP en plantas

Dhivya Selvaraj, Arul Loganathan y Sathishkumar Ramalingam

BZIP es una clase de proteínas de unión a ADN específicas de secuencia dimérica, tiene una estructura bipartita que contiene una región de aminoácidos básicos enriquecidos que se encuentra junto a las cremalleras de leucina. Se caracteriza por varios residuos de leucina regularmente espaciados en siete intervalos de aminoácidos, la región básica contacta directamente con el ADN. La cremallera de leucina media la heterodimerización y la homodimerización de los monómeros de proteínas a través de interacciones paralelas que son exclusivas de eucariotas. El genoma de la planta Arabidopsis thaliana muestra 67 proteínas BZIP. Hemos predicho las propiedades diméricas de la cremallera de leucina alfa helicoidal y la estructura de bobina enrollada de las proteínas BZIP en las plantas. En este análisis se centraron en la longitud de las cremalleras de leucina, la colocación de asparaginas en la interfaz hidrofóbica y la presencia de interacciones electrostáticas interhelicoidales. El árbol filogenético también se construyó estudiando la relación evolutiva de BZIB existente entre las plantas.