Investigación inmunológica
Acceso abierto

abstracto

Refinamiento del modelo a través de alto rendimiento computación: un ejemplo de VIH basado en agentes

Dimitri Perrin, Heather J. Ruskin, Martin Crane

Antecedentes: Los avances recientes en inmunología destacaron la importancia de las propiedades locales en la progresión general de la infección por VIH. En particular, el tracto gastrointestinal se considera un área clave durante la infección temprana, y el agotamiento celular masivo asociado con él puede influir en la progresión posterior de la enfermedad. Esto motivó el desarrollo de un modelo basado en agentes a gran escala.

Resultados: los ganglios linfáticos se implementan explícitamente y las consideraciones sobre la computación paralela permiten simulaciones grandes y la inclusión de características locales. Los resultados obtenidos muestran que la inclusión del tracto GI en el modelo conduce a una progresión acelerada de la enfermedad, tanto en las primeras etapas como en la evolución a largo plazo, en comparación con un modelo uniforme teórico.

Conclusiones: Estos resultados confirman el potencial de las políticas de tratamiento actualmente en investigación, que se centran en esta región. También destacan el potencial de este marco de modelado, que incorpora componentes basados en agentes y en redes, en el contexto de sistemas complejos en los que la ampliación por sí sola no genera modelos que brinden información adicional.