Genómica y biología fúngica
Acceso abierto

abstracto

Mitogenoma y genes diana de fungicidas con codificación nuclear de Thecaphora frezii - Agente causal del carbón del maní

Renee S. Arias, Luis I. Cazon, Alicia N. Massa, Brian E. Scheffler, Victor S. Sobolev, Marshall C. Lamb, Mary V. Duke, Sheron A. Simpson, Cinthia Conforto, Juan A. Paredes, Juan H Soave, Mario I. Buteler y Alejandro M. Rago

Antecedentes: Thecaphora frezii Carranza y Lindquist provoca la enfermedad del carbón en el maní (Arachis hypogaea L.), lo que provoca pérdidas de rendimiento de hasta un 35 %. Los fungicidas se han mostrado ineficaces para controlar la enfermedad; Considerando que la investigación sobre la base molecular de esa resistencia a los fungicidas se ha visto obstaculizada por la falta de información genética sobre T. frezii. El objetivo de este trabajo fue proporcionar información molecular sobre los loci objetivo de los fungicidas en T. frezii, incluido su genoma mitocondrial (mitogenoma) y genes críticos codificados por núcleo.

Resultados: aquí presentamos el mitogenoma completo anotado de T. frezii, una molécula de 123 773 pb que contiene los 14 genes estándar que forman parte de los complejos mitocondriales I, III, IV y V, 22 ARN de transferencia, subunidades pequeñas y grandes de ARN ribosomal, ADN polimerasa, ribonucleasa P, transcriptasa inversa GII/maturasa, nueve marcos hipotéticos de lectura abierta y endonucleasas autodirigidas (LAGLIDADG, GIY-YIG, HEG). Además, informamos la secuencia de cDNA de longitud completa de T. genes frezii citocromo b (cob) y citocromo oxidasa 1 (cox1); así como secuencias parciales de genes de succinato deshidrogenasa (sdhb) de T. frezii, biosíntesis de ergosterol (Erg4), citocromo P450 (cyp51) y beta tubulina (β-tubulina), que son objetivos respectivos de estrobilurinas, inhibidores de oxidación de quinonas, triazoles y fungicidas inhibidores de beta-tubulina de uso común en el cultivo de maní. La traducción de los genes cob y sdhb en este particular T. frezii aislado sugiere resistencia potencial a los fungicidas de estrobilurina y carboxamida.

Conclusión: El mitogenoma y las secuencias genéticas codificadas en el núcleo que se presentan aquí proporcionan las herramientas moleculares para investigar los loci objetivo del fungicida T. frezii.