Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Análisis de la secuencia del gen COI mitocondrial de Puntius ticto y comparación con siete especies del género Puntius de la familia Cyprinidae: un hallazgo para el posicionamiento filogenético y el código de barras de ADN como estudio modelo para especies crípticas

RK Garg, Nidhi Dubey, N Batav, Pooja Pandey y RK Singh

Durante las últimas tres décadas, el ADN mitocondrial (ADNmt ) ha declarado como el marcador más popular de diversidad molecular, por una combinación de consideraciones técnicas de facilidad de uso y supuestas propiedades biológicas y evolutivas de una especie. El presente estudio examinó la secuencia del gen de la subunidad I de la citocromo c oxidasa mitocondrial parcial del ADN mitocondrial para el posicionamiento filogenético de Puntius ticto entre ocho especies del género Puntius y su idoneidad para determinar la diferenciación genética entre el género Puntius. Las 05 muestras de P. ticto se recolectaron del reservorio Halali, se analizaron el gen mtcox1 de las regiones parciales mitocondriales, se secuenciaron y compararon con la base de datos en línea disponible en NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica, EE. UU.) para el resto de siete especies (P. sophore, P. sarana, P. amphibious, P. chola, P. conchonius, P. dorsalis y P. gelius). La secuenciación de 668 pb del gen mtcox1 reveló 18 haplotipos (h) con diversidad de haplotipos (gen) (Hd) 0,981 ± 0,023 y diversidad de nucleótidos (Pi) 0,658. Se registraron 504 sitios variables y sitios de parsimonia y se observaron posiciones conservadas con la misma frecuencia en la secuencia de nucleótidos y las regiones variables se visualizaron principalmente entre los nucleótidos 27 a 76. Los resultados concluyeron que el mtcox1 parcial es polimórfico y puede ser un marcador potencial para determinando el posicionamiento filogenético de Puntius ticto con el resto de siete especies. La presente investigación puede tratarse como un estudio modelo para los científicos de la vida silvestre para marcar el contrabando de especies protegidas con falsos pretextos y la importancia de los códigos de barras de ADN para detener dicho comercio ilegal.