Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Análisis espectrométrico de masas de secretoma completo y precipitado de amilasa Proteínas del secretoma de Streptococcus gordonii

Maddi A, Haase EM y Scannapieco FA

La biopelícula oral (placa dental) se forma por la adhesión inicial de “especies pioneras” a las proteínas salivales que forman la película dental en la superficie del diente. Se sabe que una de esas especies pioneras, Streptococcus gordonii, se une a la amilasa salival a través de proteínas de unión a amilasa específicas, como la proteína A de unión a amilasa (AbpA). Estudios recientes han demostrado que, una vez unida, la amilasa salival parece modular la expresión génica en S. gordonii. Sin embargo, no se sabe si esta expresión génica inducida por amilasa conduce a la secreción de proteínas que desempeñan un papel en la formación de biopelículas de placa. En este estudio, examinamos las diferencias en los proteomas secretados entre las cepas de S. gordonii KS1 (tipo salvaje) y deficientes en AbpA (ΔAbpA). También examinamos las proteínas del secretoma precipitadas diferencialmente después de la incubación con amilasa salival. Los sobrenadantes de cultivo de KS1 y ΔAbpA se analizaron mediante nano-LC/MS/MS para caracterizar los proteomas secretados completos de KS1 y ΔAbpA. Se identificaron un total de 107 proteínas en los secretomas KS1 y ΔAbpA, de las cuales se predijo que 72 proteínas tenían un péptido señal N-terminal para la secreción. Cinco proteínas se expresaron diferencialmente entre los secretomas KS1 y ΔAbpA; AbpA y sortasa B se expresaron exclusivamente por KS1, mientras que Gdh, AdcA y GroEL se expresaron solo por ΔAbpA. La incubación de sobrenadantes de cultivo de KS1 y ΔAbpA con amilasa (50 μg/ml) a temperatura ambiente durante 2 h dio como resultado la precipitación diferencial de las proteínas del secretoma. Proteína hipotética (SGO_0483), ATPasa transportadora de cationes YfgQ (Aha1), isocitrato deshidrogenasa (Icd), sortasa A (SrtA), beta-N-acetilhexosaminidasa (SGO_0405), factor de liberación de cadena peptídica 1 (PrfA) y cardiolipina sintasa (SGO_2037) fueron precipitados por la amilasa del sobrenadante del cultivo KS1. Entre las proteínas secretadas identificadas y las proteínas precipitadas por amilasa, el regulador transcripcional LytR (SGO_0535) y la ATPasa transportadora de cationes YfgQ (Aha1) son posibles proteínas de señalización.