Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

El perfil de lípidos MALDI MS distingue con precisión la tiroides papilar Carcinoma de tejido normal

Junsun Ryu, Geul Bang, Jeong Hwa Lee, Seung Ho Choi, YuhSeog Jung, Kwang Pyo Kim, Young Hwan Kim y Hark Kyun Kim

Antecedentes: La espectrometría de masas de ionización/desorción láser asistida por matriz de tejido dirigida por histología (MALDI MS) se ha utilizado para identificar perfiles de lípidos que pueden distinguir el epitelio canceroso del epitelio normal. epitelio.

Métodos: Con el fin de evaluar si los perfiles de lípidos pueden ayudar con el diagnóstico, se analizaron muestras de tumores resecados congelados recolectados de pacientes con carcinoma papilar de tiroides usando desorción/ionización láser asistida por Matrix (DHB/CHCA) ( MALDI) espectrometría de masas (MS), junto con muestras de tejido normal adyacente.

Resultados: picos de lípidos expresados diferencialmente entre muestras de cáncer y normales en una selección de características P<0.001 etiquetas de clase predichas correctamente de muestras del conjunto de prueba (7 pares) en 100 particiones aleatorias de entrenamiento para prueba, a la precisión de predicción de clase media del 100%. Además, los picos de lípidos expresados diferencialmente entre 14 pares de cáncer y muestras normales adyacentes predijeron correctamente el 100 % de las muestras del conjunto de validación (8 de 8 muestras). Las fosfatidilcolinas (PC) 32:0 y PC 34:1, la esfingomielina 34:1 y varios fosfatidilinositoles se sobreexpresaron, mientras que la lisofosfatidilcolina 18:3 y la lisofosfatidilserina 18:1 se subexpresaron en los carcinomas papilares de tiroides, en comparación con el tejido normal.

Conclusiones: Los perfiles de EM MALDI de lípidos distinguen con precisión el epitelio del carcinoma papilar de tiroides del epitelio normal y demuestran el potencial como ayuda diagnóstica.