Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Aislamiento, clonación, secuenciación de ADN y análisis bioinformático del gen Parasporin–1 de Bacillus thuringiensis

Abdulrahman S Assaeedi y Gamal H Osman

Se aislaron cepas nativas de Bacillus thuringiensis y se analizaron para detectar la presencia del gen parasporin–1 . La amplificación de ADN basada en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) utilizando los cebadores específicos de genes se utilizó para este fin. De todas las cepas aisladas, solo cuatro exhibieron amplicones de un tamaño análogo al del gen parasporin–1 conocido. Los fragmentos amplificados se clonaron en el vector pGEM y luego se secuenciaron y analizaron. El análisis bioinformático reveló que las secuencias de nucleótidos obtenidas de los aislados eran 99 % homólogas a la secuencia de ADN conocida del gen de la parasporina (software Blast) y 98 % homólogas a la secuencia de aminoácidos conocida. La secuencia del gen de la parasporina obtenida de este estudio se envió a GenBank (Nº de acceso KJ576792). Se descubrió que el gen de 2371 nucleótidos de longitud codifica una proteína compuesta por 789 aminoácidos que tenía un peso molecular estimado de 84 kDa y un punto isoeléctrico (pI) calculado de 6,7.