Revista internacional de minería de datos biomédicos
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abstracto

Intersection of proteomics and bioinformatics in deciphering novel functions of proteins

Malini Laloraya

Las proteínas solo de vez en cuando funcionan sin nadie más; a menudo se asocian con diferentes biomoléculas para lograr sus capacidades. Las redes de tales comunicaciones biomoleculares establecen la razón para siempre, y las que ocurren entre proteínas asumen funciones especialmente significativas. Recientemente hemos desglosado la trampa de la conexión de proteínas durante la actividad hormonal y los resultados de tales comunicaciones. Hablaré sobre las colaboraciones de los receptores de hormonas con la proteína de interfaz y los componentes básicos involucrados en esta afiliación. También mostraré cómo estas asociaciones causan el empeoramiento de los síntomas provocados por las hormonas. Una comprensión profunda de la relación entre la proteína y el receptor, así como la ruptura de la articulación cómplice colaboradora, podría ser el punto urgente en la formulación de mejores tratamientos para controlar los eventos relacionados con ellos. Adoptando esta estrategia aún más, examinaré cómo el examen del interactoma puede distinguir a los nuevos cómplices, particularmente de acuerdo con la compartimentación espacial en la célula. Resumiré cómo se reconoce que las proteínas citosólicas de estilo antiguo son parte del interactoma atómico. Aclararé cómo se unióEl enfoque bioinformático y proteómico se puede utilizar para anticipar su capacidad atómica. Además, una metodología integradora con bioinformática y mutagénesis coordinada en el sitio afirma la premisa de estas comunicaciones. Finalmente, delinearé utilizando análisis in vivo cómo se pueden demostrar estas colaboraciones y su esencialidad útil.

La utilización de avances de alto rendimiento para considerar los marcos de la ciencia atómica en las décadas anteriores ha alterado la exploración natural y biomédica, lo que permite a los analistas examinar deliberadamente los genomas de las formas de vida (genómica), la disposición de las partículas de ARN (transcriptómica) y la disposición de las proteínas . incluyendo sus estructuras y capacidades (Proteómica). Dado que las proteínas involucran un terreno central molecularmente entre calidad y registro y muchos niveles más elevados de estructura y asociación atómica y celular, y generalmente los procesos fisiológicos y obsesivos se muestran a nivel de proteína, los investigadores naturales y biomédicos están cada vez más interesados ​​​​en aplicar proteómica de alto rendimiento .estrategias para lograr una comprensión superior de la ciencia subatómica fundamental y formas de infección.

La abundancia de información proteómica permite a los analistas plantear preguntas orgánicas complejas y agregar nuevas experiencias lógicas. Para ayudar a la teoría impulsada por la información, la edad y la divulgación natural de la información, se han creado numerosas bases de datos de bioinformática relacionadas con proteínas, oficinas de investigación e instrumentos de programación de análisis de información para clasificar y dar explicaciones orgánicas a las proteínas para ayudar a las investigaciones de organización, auxiliares, prácticas y de desarrollo con respecto a a la ciencia de caminos, sistemas y marcos. Con los avances fenomenales en curso en las ciencias del genoma y las innovaciones de secuenciación de próxima generación (NGS) que han revelado datos genómicos ricos en una inmensa cantidad de formas de vida, la nueva bioinformática de proteínasademás, se presentan bases de datos y se han mejorado muchas bases de datos existentes. A medida que se secuencia un número cada vez mayor de genomas, las sucesiones de proteínas registradas en las bases de datos se han expandido significativamente en los últimos tiempos. Esto plantea nuevas dificultades para el investigador computacional en la construcción de un nuevo marco para ayudar a la investigación científica de proteínas en el período de Big Data.

El Proyecto de ontología genética utiliza tres clasificaciones para representar un elemento o proteína de calidad. La función subatómica es la clasificación que describe las tareas realizadas por proteínas singulares y puede aislarse ampliamente en doce subcategorías; específicamente formas celulares, digestión, replicación/ajuste de ADN, registro/interpretación, señalización intracelular, correspondencia célula-célula, colapso/corrupción de proteínas, transporte, proteínas multifuncionales, citoesquelético/auxiliar, resistencia e invulnerabilidad y capacidades aleatorias. Las proteínas básicas, por ejemplo, son responsables de la confiabilidad celular y la forma celular en general, sus capacidades difieren de la fabricación del citoesqueleto para acumular canales de partículas transmembrana, una estructura básica para la osmolaridad celular y, en cualquier caso, para el movimiento de datos sinápticos. No solo el átomo de ADN no puede imitarse a sí mismo sin un aparato proteico, por ejemplo, el complejo de grabación o la burbuja de grabación; Sin embargo, los eventos de mitosis y meiosis de la duplicación celular y la creación de gametos no pueden continuar sin que las proteínas realicen eventos transversales y el aislamiento cromosómico. El marco invulnerable, responsable de la resistencia de nuestro cuerpo, depende del reconocimiento de la estructura, de la separación del yo del no-yo; esto debe ser concebible a través de en la separación del yo del no-yo; esto debe ser concebible a través de en la separación del yo del no-yo; esto debe ser concebible a través decélulas que pueden atar y reconocer lo que no es familiar para el cuerpo. Tales formas de reconocimiento ocurren a través de asociaciones proteína-proteína en el exterior de las células del sistema invulnerable, donde la restricción del cariño puede decidir si se iniciará o no una reacción insensible y, además, donde las conexiones o reconocimientos de proteínas no apropiados pueden causar autoseguridad. infecciones Las respuestas bioquímicas de la respiración celular, el transporte de oxígeno y gas carbónico, la ingestión de alimentos, el uso de energía, el almacenamiento de energía, las respuestas fisiológicas de calor o frío, o cualquier proceso de vida que uno pueda entender, se completa esencialmente con una proteína o un complejo proteico. Todos los procesos que ocurren en un ser vivo tienen proteínas que actúan en algún lugar, de manera exacta, creadas bajo los pesos de la elección normal.

Estos son solo algunos ejemplos de trabajo con proteínas. Una realidad asombrosa es que todas las tareas que pueden realizar dependen de una pauta típica, los veinte aminoácidos que pueden formar una proteína. Esa es la razón por la cual es tan importante examinar las proteínas, su composición, estructura, componentes y capacidad. Deberíamos ver cómo se superponen estas partículas, cómo se acumulan en los edificios, cómo funcionan si queremos responder a direcciones, por ejemplo, por qué tenemos malignidad, por qué envejecemos, por qué nos enfermamos, cómo podemos descubrir remedios para algunas enfermedades, por qué la vida tal como la conocemos ha avanzado en este sentido y en este planeta y no en ningún otro lugar, al menos para la ocasión.

Según el Oxford English Dictionary, Structural Bioinformatics está conceptualizando la ciencia con respecto a los átomos, en el sentido de la ciencia física y aplicando métodos informáticos, obtenidos de órdenes, por ejemplo, aritmética, ingeniería de software y conocimientos, para comprender, componer e investigar los datos básicos relacionados. a estas partículas para un alcance enorme. Hay algunas estrategias computacionales para la garantía de la estructura de la proteína, incluida la demostración de homología, el reconocimiento de pliegues por medio de técnicas de iniciación de cuerdas y músculos del estómago.

El aumento colosal en la medida de la agrupación y la información de estructura de las proteínas, junto con los impulsos en las estrategias bioinformáticas exploratorias y computacionales, están mejorando nuestra comprensión sobre la relación entre la disposición, la estructura, los elementos y la capacidad de las proteínas. Esta información, por lo tanto, se está utilizando para ver cómo las proteínas colaboran con otros átomos, por ejemplo, pequeñas partículas o ligandos que pueden convertirse en un medicamento emergente. La última área es una actividad que capacitará al lector o estudiante. aplicar algunos instrumentos bioinformáticos a partir de una sucesión fraccional de ADN o un número de promoción de proteínas y obtener un modelo de su estructura y capacidad.