Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Interacción de las variantes CTX - M de 2009 con fármacos e inhibidores: un estudio de modelado molecular y acoplamiento

Shazi Shakil y Asad Ullah Khan

Espectro extendido- β Las -lactamasas (BLEE) son enzimas producidas por bacterias que confieren resistencia a las cefalosporinas de generación avanzada. Las enzimas CTX-M se han convertido en las ESBL más prevalentes. No se informan los residuos de aminoácidos a través de los cuales las variantes de CTX-M de 2009 interactúan con fármacos e inhibidores. Se prepararon modelos de homología para CTX-M-15 (este estudio), CTX-M-53, CTX-M-71, CTX-M-82 y CTX-M-89. Se encontró que las puntuaciones Z de Ramachandran para los modelos eran -0.449, 0.006, -0.103, -0.007 y 0.092, respectivamente. Estos modelos se acoplaron con fármacos diana (cefotaxima, ceftazidima, cefepima) e inhibidores (clavulanato, sulbactam, tazobactam). El marcador bla CTX-M-15 se amplificó mediante PCR a partir de ADN plasmídico de un aislado clínico de Escherichia coli. Las concentraciones inhibitorias mínimas (CIM) de los fármacos se analizaron mediante el método de microdilución en caldo. Las células de E. coli C600 (que albergan bla CTX-M-15 clonado) resultaron positivas para la producción de ESBL mediante la prueba de sinergia de doble disco. Se encontró que el marcador bla CTX-M-15 era transmisible a través de la conjugación. El análisis de Discovery Studio de las estructuras acopladas reveló que, independientemente del tipo CTX-M, la ceftazidima interactuaba con los residuos A226, G227, L228, P229, A/T230, S231, W232, R285, T288, D289, G290 y L/Y291 . Además, se encontró que sulbactam se unía de manera más eficiente a las enzimas estudiadas sobre la base de las energías de interacción. El estudio identifica residuos de aminoácidos cruciales para el ‘fármaco CTX-M’ y ‘inhibidor de CTX-M’ interacciones que podrían ser útiles en la búsqueda continua de un inhibidor de CTX-M versátil.