Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Análisis bioinformático integrado de los datos de proteínas disponibles públicamente Muestra evidencia del 96 % del proteoma humano

Suresh Mathivanan

Los genes que codifican proteínas se predicen mediante procesos de anotación del genoma y se traducen conceptualmente en secuencias de proteínas. Varios miles de estos genes codificadores de proteínas catalogados en bases de datos disponibles públicamente rara vez tienen evidencia a nivel de proteína. En este estudio, hemos creado un mapa del proteoma humano mediante la integración de estudios y recursos proteómicos disponibles públicamente. Con los datos incluidos, podemos mapear el 96 % del proteoma humano con amplia evidencia experimental para la expresión de proteínas. Se registran más de 2,2 millones de anotaciones para 19 716 proteínas de 63 239 estudios independientes que utilizaron más de 800 tejidos/tipos de células/fluidos corporales. Entre el proteoma humano mapeado, el 96% de la expresión de la proteína está respaldada por dos o más estudios independientes o métodos experimentales. Los datos recopilados (localización, expresión tisular, modificaciones postraduccionales, interacciones proteínaproteína, enzima-sustrato y estructuras 3D) son de libre acceso a través del compendio basado en la web Human Proteome Browser (http://www.humanproteomebrowser.info).