Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

El enfoque in-silico explica la evolución de las betalactamasas de la penicilina Proteínas de unión

Privita Verma, Aditi Upadhyay, Monalisa Tiwari y Vishvanath Tiwari

Las proteínas de unión a penicilina (PBP) poseen actividades de transpeptidasa, transglucosilasa y carboxipeptidasa y median el entrecruzamiento de N-acetilglucosamina (NAG) y N -ácido acetilmurámico (NAM) de peptidoglicano, favoreciendo así la síntesis de la pared celular. Los antibióticos β-lactámicos se unen a las PBP y las inactivan, matando así a las bacterias. Durante el curso de la evolución, las bacterias también han desarrollado estrategias diferenciales de supervivencia. La aparición de resistencia a múltiples fármacos resultante de las β-lactamasas constituye una amenaza mundial. Esta enzima hidroliza los antibióticos β-lactámicos y los inactiva. El objetivo de este estudio fue analizar la afinidad de unión de antibióticos β-lactámicos con PBP y β-lactamasas mediante estudios de acoplamiento computacionales. Para ello, se utilizaron como ligandos de interacción molecular diferentes clases de β-lactámicos conocidos hasta la fecha. El análisis computacional se realizó utilizando GLIDE basado en funciones de puntuación. El patrón de afinidad de unión se determinó en términos de sus energías de unión. Los resultados demostraron que la mayoría de los antibióticos β-lactámicos interactúan tanto con las β-lactamasas como con las PBP, lo que revela una posible ascendencia entre las β-lactamasas y las PBP, ya que ambas reconocen sustratos comunes. Por lo tanto, el presente trabajo puede ser útil en el estudio de la relación evolutiva entre las β-lactamasas y las PBP a nivel catalítico.