Plantas Aromáticas y Medicinales
Acceso abierto

abstracto

Análisis In-Silico, Modelado Estructural y Análisis Filogenético de Gen Acetohidroxiácido Sintasa de Oryza sativa

Ubaid Yaqoob, Tanushri Kaul e Irshad Ahmad Nawchoo

La Acetohidroxiácido Sintasa (EC 2.2.1.6) o Acetolactato Sintasa (ALS) pertenece a una familia de enzimas dependientes de difosfato de tiamina (TPP) que cataliza la primera reacción en la biosíntesis de amino esenciales ácidos - isoleucina, leucina y valina. La acetohidroxiácido sintasa (AHAS) está presente en plantas, algas, hongos y bacterias y se ha descubierto que es un objetivo vital de múltiples herbicidas. Revelamos el modelo de homología de la proteína OsAHAS utilizando la estructura de Arabidopsis thaliana AHAS (PDB ID: 3E9Y) como plantilla. La estructura del modelo resultante fue refinada por PROCHECK, ProSA, RMSD y Verify3D que indicaron que la estructura del modelo es confiable con una identidad de secuencia de aminoácidos del 76 % con la plantilla. RMSD (1,75Å), Verify3D (86,02 %), Z-score (-9,55) y el análisis gráfico de Ramachandran mostraron que las conformaciones para el 81,6 % de los residuos de aminoácidos se encuentran dentro de las regiones más favorecidas. El árbol filogenético construido reveló diferentes grupos basados en AHAS con respecto a bacterias, hongos, algas y plantas. La alineación de secuencias múltiples de estas secuencias de proteína AHAS de diferentes organismos mostró regiones conservadas en diferentes tramos con homología en residuos de aminoácidos. A través del análisis de motivos, se reveló que el dominio AHAS conservado se encuentra en todas las proteínas AHAS, lo que sugiere su posible papel en las funciones celulares y metabólicas.