ISSN: 2385-5495
Jiri Hatina, Michaela Kripnerova, Hamendra Singh Parmar, Zbynek Houdek, Pavel Dvorak, Katerina Houfkova, Martin Pesta, Jitka Kuncova, Sieghart Sopper, Lenka Radova, Jiri Sana, Ondrej Slaby
Los sarcomas de tejidos blandos son conocidos por su gran variabilidad en el comportamiento clínico, que va desde lesiones casi indolentes hasta tumores que metastatizan rápidamente. Los genes responsables de la progresión del sarcoma han sido mal caracterizados hasta ahora. Con este fin, analizamos exhaustivamente los transcriptomas de dos series de progresión de fondo único de líneas celulares de sarcoma murino. El primero, establecido por nosotros a partir de fibrosarcomas consecutivos en un ratón transgénico v-jun, consistió en la línea celular no invasiva y no móvil de proliferación lenta JUN-2, la línea celular invasiva, móvil y de proliferación rápida JUN-3, y la línea celular JUN- 2fos-3 que exhibe un patrón de transformación único, con poca desregulación del crecimiento y proliferación celular, pero motilidad e invasividad pronunciadas. El segundo, establecido por un grupo francés, consistía en la línea celular preadipocítica 3T3L1, ampliamente utilizada, y su línea celular derivada de liposarcoma LM3D. A partir de ambas líneas celulares de liposarcoma, aislamos células madre putativas de liposarcoma (como células de población lateral). Realizamos cuatro conjuntos de análisis transcriptómicos de todo el genoma. La serie de progresión de fibrosarcoma JUN, en virtud de su distribución única de rasgos relacionados con la transformación entre líneas celulares individuales, nos hizo posible identificar dos grupos separados de genes tentativamente involucrados en la progresión del sarcoma en un solo análisis transcriptómico, por un lado, proliferación- los genes relacionados podrían identificarse por su expresión diferencial en JUN-3 en comparación con JUN-2 y JUN-2fos3 y, por otro lado, los genes relacionados con la motilidad y la invasividad podrían identificarse por su patrón de expresión común en JUN-2fos3 y Células JUN-3 comparadas con JUN-2. En cuanto a la serie de progresión del liposarcoma, identificamos, por un lado, genes de progresión, por su expresión diferencial en células preadipocíticas 3T3L1 frente a células de liposarcoma LM3D, y, por otro lado, genes de stemness, mediante el perfilado de células de población lateral frente a células de población no laterales de ambas líneas celulares. El análisis de expresión génica de alto rendimiento se ha realizado utilizando la matriz de genoma de ratón GeneChip 430 2.0 (ThermoFisher Scientific). Finalmente, identificamos un pequeño grupo de genes co-regulados en células altamente transformadas tanto en JUN-3 como en LM3D (firma de "progresión del sarcoma"). Una característica llamativa de esta “progresión del sarcoma” La firma es la compleja regulación a la baja de la vía de señalización canónica de Wnt/β-catenina. Los genes regulados al alza involucran una amplia gama de genes con función publicada como inhibidores de Wnt/β-catenina (Dickkopf-2 y -3, Apcdd1, Meg3, Fibulin-5, Ints6, Msx1), por otro lado, el perfil de expresión sugiere fuertemente activación de la vía no canónica Wnt5-Ror2. Otro extenso conjunto de genes incluye genes, cuya expresión elevada presagia mal pronóstico en varios carcinomas, cuya expresión en sarcomas no se ha analizado hasta ahora, sin embargo. Estos genes incluyen Snx6, transportador uea Slc14A1, Dpysl3, Ulk2, receptor transitorio potencial del canal de calcio Trpc1, Steap3, Morc4, Crp2 y Coronin 1C). Algunos de los genes ya han sido descritos como indicadores de mal pronóstico en determinados tipos de sarcomas de partes blandas o en osteosarcomas (Tbx3, Tgfbi, Rab3ip, Alcam, Crabp1, Ecm1, periostin). Curiosamente, aunque la población de células a granel de las series de progresión de fibrosarcoma y liposarcoma proporcionó la información para el análisis, una parte de los genes regulados al alza en la "progresión de sarcoma" La firma recuerda mucho a la activación de la troncalidad (c-jun y genes que codifican sus activadores, Ddx21 y Mfap, así como genes que codifican los factores de empalme alternativos asociados con la troncalidad Khdrbs3 y Mbln3, así como Lis1, que parece estar involucrado en células madre asimétricas). división). De lo contrario, la regulación de la troncalidad parece estar dominada por distintos factores en ambas series respectivas de progresión del sarcoma, siendo Sox-2 un candidato probable en las células de fibrosarcoma JUN-3, y una amplia gama de genes de la vía Hippo (Yap, FoxM1, Pttg, Tacc3, Btf3, así como Lats2) se regulan al alza tanto en las células madre adipocíticas como en las de liposarcoma. Creemos que nuestros modelos y genes expresados diferencialmente identificados por su análisis transcriptómico pueden proporcionar nueva información importante sobre la biología del sarcoma de tejidos blandos y pueden ayudar a identificar nuevos marcadores de pronóstico y objetivos terapéuticos potenciales para este tipo de tumor raro y altamente heterogéneo.