Diseño de fármacos: acceso abierto

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Acceso abierto

ISSN: 2169-0138

abstracto

Información sobre la accesibilidad superficial de los fragmentos peptídicos de la proteína de la cubierta del virus del mosaico de la alfalfa (AMV) a niveles fisicoquímicos e inmunoquímicos

Gomase VS y Kale KV

El virus del mosaico de la alfalfa (AMV) infecta a más de 600 especies de plantas en 70 familias (huéspedes experimentales y naturales). Las proteínas de la cubierta son materiales importantes para hacer correlaciones estructura-función con péptidos biológicamente activos a niveles fisicoquímicos e inmunoquímicos y también son buenos modelos para observar los cambios evolutivos en las moléculas de proteínas. péptidos antigénicos en la posición 1-MSSSQKKAGGKAGKPTKRSQN-21; 151-PTHAGMQNQNF-161; 22-YAALRKAQLPKPPALKVPVVKPT-44 de la proteína de la cubierta del virus del mosaico de la alfalfa son los más adecuados para el desarrollo de vacunas de subunidades porque con un solo epítopo, la respuesta inmunitaria se puede generar en una gran población. En esta investigación, utilizamos los algoritmos PSSM y SVM para la predicción de MHC clase I & II péptido de unión, antigenicidad, accesibilidad del solvente, residuos polares y no polares para analizar las regiones que probablemente estén expuestas en la superficie de las proteínas que son potencialmente antigénicas, lo que permite que los posibles objetivos de fármacos identifiquen sitios activos contra la infección, así como para diseñar vacunas de péptidos sintéticos.

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