Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Estudio in silico de la inhibición selectiva de las deformilasas peptídicas bacterianas por parte de varios fármacos

Abdelouahab Chikhi y Abderrahmane Bensegueni

Para contrarrestar los crecientes niveles de resistencia a los patógenos, se necesitan sin demora nuevas clases de antibióticos. La metaloenzima péptido deformilasa (PDF) corresponde a uno de los objetivos bacterianos más prometedores en la búsqueda de un nuevo modo de acción de los antibióticos y se seleccionó en primer lugar como un objetivo bacteriano específico. Los análogos de péptidos se desarrollaron como inhibidores que contenían un hidroxamato o formil-hidroxilamina como grupo de interacción de metales, y se usaron como inhibidores con actividad in vitro contra un amplio espectro de organismos y actividad antibacteriana exitosa in vivo que armoniza con buenas propiedades farmacocinéticas y excelente tolerabilidad en diversos especie, pero recientemente se descubrió un homólogo humano. Se desarrolló una nueva estrategia para seleccionar compuestos altamente eficientes con bajo efecto de inhibición frente a la PDF humana. Una clase original de pequeños inhibidores no peptídicos de la péptido deformilasa (PDF) como antibióticos potentes como el grupo indol y sus derivados con el mismo modo de acción in vivo que los inhibidores de PDF previamente identificados pero sin los efectos apoptóticos de estos inhibidores en humanos células, ha sido descubierto. Este estudio ha confirmado la acción selectiva de estos compuestos sobre las PDF bacterianas mediante el método de acoplamiento utilizando el programa autodock. De hecho, se observó una buena correlación entre los valores de IC50 y deltaG de diferentes complejos PDF-inhibidores. La evaluación de las diversas propiedades moleculares de estos inhibidores nos permite concluir que es muy probable que todos estos compuestos se puedan administrar como fármacos.