Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Predicción estructural y funcional in silico de la proteína hipotética PHA de Phaseolus vulgaris VU_004G136400g

Zohaib Bashir, Muhammad Rizwan, Kanwal Mushtaq, Anum Munir e Ishtiaq Ali

Las proteínas hipotéticas (HP) son las proteínas cuya aparición se ha predicho, pero la función in vivo no se ha fabricado. Ilustrar las visiones confidenciales estructurales y funcionales de estos HP también podría impulsar una mejor comprensión de las relaciones o redes proteína-proteína en diversas formas de vida. El frijol común (Phaseolus vulgaris) es la leguminosa alimenticia más importante para el consumo humano directo en el mundo, la leguminosa de grano más importante para el consumo humano y tiene un papel en la agricultura sostenible ayudando a su capacidad para fijar nitrógeno atmosférico. Sin embargo, a pesar de la importancia de esta especie de cultivo, su genética ha sido pobremente caracterizada. En el presente estudio, se eligió la proteína hipotética de Phaseolus vulgaris (Frijol común) para el análisis y el modelado mediante aparatos y bases de datos bioinformáticos distintivos. Como indica el análisis de la estructura primaria y secundaria, XP_007152511.1 es una proteína hidrofóbica estable que contiene una extensión notable de hélices α; El modelado de homología se utilizó en el servidor SWISS-MODEL donde la identidad de las plantillas con la proteína XP_007152511.1 fue menor, lo que demostró la novedad de nuestra proteína. La estrategia inicial de Ab se llevó a cabo para producir su estructura 3D. Unas pocas evaluaciones de evaluación de calidad y parámetros de validación determinaron que el modelo de proteína generado era estable con una calidad realmente excelente. ProtFun 2.2 completó el análisis funcional y KEGG (KAAS) recomendó que la proteína hipotética sea un factor de traducción con dominio nuclear. Se observó que la proteína es energética para el proceso de traducción, está involucrada en las barreras transmembrana, los procesos celulares y de señalización y la unión a proteínas. Se sugiere que la aprobación de más pruebas ayudaría a anticipar las estructuras y funciones de otras proteínas no caracterizadas de diferentes plantas y seres vivos.