Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Análisis funcional in silico de los genes FLC y FT responsables de posponer y acelerar el inicio de la floración

Mostafa Khoshhal Sarmast

En este documento se investigaron los análisis funcionales in silico de los genes FLOWERING LOCUS C (FLC) y FLOWERING LOCUS T (FT). El reconocimiento de los módulos reguladores en cis y su organización son un requisito previo para obtener información sobre la regulación de la expresión génica. En consecuencia, este estudio llevó a cabo un análisis de promotores en los genes FT y FLC en Arabidopsis y sus ortólogos en Prunus persica por servidores PlantPan y PLANCARE en los que el sitio de unión del factor de transcripción integrador (TFB) estaba involucrado en señales hormonales y de estrés. También se estudiaron los elementos sensibles a la luz. Entre los elementos de respuesta identificados en FT y FLC, Arabidopsis tuvo el mayor número de elementos de respuesta. Esto se debe en parte a que P. persica es de día neutro, mientras que Arabidopsis es una planta facultativa de día largo. Los resultados del reconocimiento de motivos en las proteínas FT y FLC con el servidor MEME mostraron que FT está muy conservado, pero la cantidad de motivos sugiere que la proteína FLC tenía muchos más motivos, lo que probablemente se deba a su mayor longitud de aminoácidos. El servidor web de PlantPan encontró algunos TF especificados como AGAMOUS (AG), AGAMOUS LIKE (AGL), LEAFY (LFY) y APETALA1 (AP1) en los promotores de FT y FLC’ análisis. También estuvieron presentes en el análisis de la red de interacción proteína-proteína, lo que plantea la cuestión de si FT o FLC pueden o no ser reguladores positivos o negativos de su propia expresión en un circuito de retroalimentación.