Investigación inmunológica
Acceso abierto

abstracto

Predicción inmunoinformática de una vacuna basada en péptidos contra africanos Virus de la peste equina

Malaz Abdelbagi, Tarteel Hassan, Mohammed Shihabeldin, Sanaa Bashir, Elkhaleel Ahmed, Elmoez Mohamed, Shawgi Hafiz, Abdah Abdelmonim, Tassneem Hamid, Shimaa Awad, Ahmed Hamdi, Khoubieb Ali y Mohammed A. Hassan

Antecedentes: La peste equina africana (AHS, por sus siglas en inglés) es una enfermedad viral de los équidos. Se transmite por mosquitos hematófagos Culicoides (Diptera, Ceratopogonidae) y causa una enfermedad grave en el caballo que puede causar la muerte. El virus de la peste equina africana (AHSV) es un virus de ARN de doble cadena (dsRNA) con diez segmentos de genoma que codifican siete proteínas estructurales (VP1-VP7) y cuatro proteínas no estructurales (NS1, NS2, NS3, NS3A). El objetivo de este estudio es analizar la proteína (VP2) de las cepas del virus de la peste equina africana (AHSV) informadas en la base de datos del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) para seleccionar todos los epítopos posibles que pueden usarse para diseñar una vacuna peptídica.

Materiales y métodos: Se recuperaron un total de 27 secuencias de la proteína de la cápside externa (VP2) del virus de la peste equina africana (AHSV) de la base de datos del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) (https:/ /www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/?term=VP2+African+horse+sickness+virus) el 7 de septiembre de 2016. En ellos se realizaron varias pruebas utilizando la base de datos de análisis de epítopos inmunes (IEDB) para detectar los epítopos inmunogénicos altamente conservados de las células B y T a partir de los cuales se seleccionarán todos los epítopos posibles que pueden usarse como una vacuna peptídica terapéutica.

Resultados y discusión: con respecto a los epítopos que provocarían una respuesta inmunitaria de anticuerpos, se propusieron "FSPEYY, DKVVEDPESY y YDTDQNVV" para estimular las células B. Si bien 5 epítopos para cada MHC I y II se abordaron como epítopos potencialmente prometedores, ya que se unen al mayor número de alelos, se encontró que todos estos epítopos tenían una alta afinidad de unión y la energía de unión más baja a la molécula MHC equina de clase I (ELA-A3 ) haplotipo a nivel estructural. Los epítopos “YAYCLILAL y YTFGNKFLL” estaban representados porque estaban unidos al mayor número de alelos. A pesar de unirse a 4 alelos, el epítopo WFFDYYATL estuvo representado porque tiene la energía global más baja. Hasta donde sabemos, no existe una vacuna basada en epítopos para el virus de la peste equina africana (AHSV) que utilice enfoques in silico.