Revista de métodos de diagnóstico médico
Acceso abierto

abstracto

Identificación de subtipos tumorales de carcinoma endometrial mediante la integración de conjuntos de datos heterogéneos

Kim H, Bredel M, Park H, Chuang JH

El proyecto Cancer Genome Atlas (TCGA) ha puesto a disposición múltiples conjuntos de datos heterogéneos. Aunque se han propuesto varios enfoques metodológicos para la integración de datos heterogéneos, no existe un marco de factorización de matriz no negativa (NMF) dispersa para manejar la integración de datos biológicos heterogéneos. Aquí, proponemos el NMF disperso ponderado en bloque (bwsNMF) para identificar subtipos de tumores de carcinoma de endometrio mediante la integración de expresión génica, mutaciones, una red de interacción proteína-proteína y una red objetivo de factor de transcripción.