Ciencias Avícolas, Pesqueras y de Vida Silvestre
Acceso abierto

abstracto

Identificación de biomarcadores moleculares relacionados con el estrés en el pez cebra empleando un enfoque in-silico para acceder a los riesgos basados en la toxicidad en la acuicultura

Md Mursalin Khan*, Ashiqul Islam SM y Ahmed Mustafa

El estrés inducido por la toxicidad en los peces se ha convertido recientemente en una preocupación importante en la acuicultura. El monitoreo de los factores de riesgo de manera rutinaria puede salvar a los acuicultores de una cantidad sustancial de pérdidas. El metanálisis brinda una forma exitosa para la detección de alto rendimiento de sustancias químicas inductoras de estrés en los hábitats de los peces mediante la explotación firme de biomarcadores moleculares. El metanálisis informado anteriormente reveló proteínas Top-21 que con frecuencia están relacionadas con perfiles de proteoma inducidos por estrés. Realizamos un análisis computacional adicional sobre la categorización funcional específica, la red de interacción proteínaproteína (PPI) y los perfiles de coexpresión para estas 21 proteínas principales en busca de biomarcadores moleculares más consistentes y sólidos. El análisis identificó biomarcadores moleculares específicos de clase funcional: para las proteínas de choque térmico, los biomarcadores propuestos son hsp90b1, hsp90ab1, hspa5, hspa8, hspa9 y ptges3a; para las proteínas del citoesqueleto, los biomarcadores propuestos son actb1, myhz2 y zgc:55461, rac1, tuba1/2, tuba1 y zgc:136799; para las proteínas de queratina, los biomarcadores propuestos son Krt 4, Krt5, krt23, krt17, sc:d0144, cldnb, icn2 y pkp3; para las proteínas de defensa frente al daño oxidativo los biomarcadores propuestos son txn, prdx5, adh2a y prdx2. Estos biomarcadores moleculares predichos pueden considerarse candidatos potenciales para identificar los factores de estrés presentes en los hábitats de los peces, ya que los biomarcadores son parte integral de la modulación del estrés. Además, como consecuencia del estudio, las proteínas reportadas también pueden aplicarse como reguladores del estrés en peces. Nuestro estudio ayudará a los investigadores a encontrar proteínas adecuadas para biomarcadores y reguladores del estrés. Será útil una mayor validación en laboratorio húmedo de esas proteínas propuestas como biomarcadores y reguladores para llevar a la implementación práctica de nuestra propuesta.