Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Identificación de posibles genes clave asociados con GBM mediante métodos computacionales

Donthula Niveditha*, M. Jahanavi

El glioblastoma multiforme (GBM) es un tumor maligno que afecta el cerebro o la columna vertebral, es un tumor de crecimiento rápido y tumor cerebral agresivo. Existe la necesidad de identificar nuevos objetivos en GBM para mejorar nuestra comprensión de biología de la enfermedad y que se puede utilizar para desarrollar nuevas terapias. Por lo tanto, el objetivo de nuestro estudio fue explorar genes clave que están asociados con GBM utilizando métodos computacionales. En el presente estudio, tenemos construyó una red de interacción de 159 genes en GBM. 13 de los 159 genes fueron seleccionados como genes hub utilizando métodos de análisis topológico, es decir, CYTOHUBBA y MCODE. Análisis de enriquecimiento funcional para estos 13 Los genes se realizaron usando DAVID y encontraron que los genes se enriquecieron en varias funciones y vías. entre los cuales la regulación del proceso apoptótico, la proliferación celular fueron los más asociados con él. Ontología de genes análisis revela que se encontraron 14, 111 y 17 términos en el proceso celular, proceso biológico y proceso molecular función respectivamente. El análisis de supervivencia de estos 13 genes se realizó utilizando el diagrama de Kaplan Meier. Este reveló que 9 de los 13 genes centrales estaban relacionados con la supervivencia general de los pacientes con GBM. VEGFA, TP53, STAT3, EGFR, NOTCH2, MMP9, MYC, HRAS, PTEN pueden servir como posibles genes clave asociados con GBM para diagnóstico, pronóstico y tratamiento de GBM.