Transcriptómica: Acceso Abierto
Acceso abierto
ISSN: 2329-8936
ISSN: 2329-8936
Vibha Mandhan y Kashmir Singh
La Stevia rebaudiana Bertoni, debido a su importancia nutricional y su uso emergente como edulcorante natural, está ganando atención en todo el mundo. Para comprender mejor la red reguladora de genes de esta planta, hemos iniciado la secuenciación de ARN pequeños de alto rendimiento para descubrir nuevos microARN (miARN). Los miARN son una clase de pequeñas moléculas de ARN no codificantes endógenas cortas de aproximadamente 18-22 nucleótidos de longitud cuya función principal es regular a la baja la expresión génica de diferentes maneras, como la represión traduccional, la escisión del ARNm y la modificación epigenética. Construimos una biblioteca de ARNs de S. rebaudiana y, después de secuenciarla con el analizador de genoma illumina II, se obtuvo un total de 30 472 534 lecturas que representan 2 509 190 secuencias distintas. A partir de estas lecturas, se predijeron doce 12 nuevos miARN cuyos precursores se generaron potencialmente a partir de secuencias de nucleótidos y EST de stevia. Todas las secuencias novedosas no se han descrito anteriormente en stevia u otras especies de plantas. Se predijeron genes diana putativos para la mayoría de los miARN novedosos, que incluyen principalmente enzimas codificantes de ARNm que regulan las vías metabólicas y de señalización esenciales de las plantas. Nuestro resultado ha aumentado la cantidad de miARN en la stevia, lo que debería ser útil para una mayor investigación sobre las funciones biológicas y la evolución de los miARN en la stevia y otras especies de plantas.