Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Identificación y caracterización estructural de los péptidos de beta-defensina 2 aviar de faisán y codorniz

L Kannan, R Liyanage, JO Lay Jr., B Packialakshmi, NB Anthony y NC Rath

Se identificaron ortólogos de faisán y codorniz de β-defensina 2 aviar (AvBD2) mediante el cribado de extractos heterófilos utilizando el tiempo de ionización por desorción láser asistida por matriz. espectrometría de masas (MS) of-Flight (MALDI-TOF), perfiles comparativos, caracterizaciones químicas y bioinformáticas. En los extractos heterófilos de cada faisán y codorniz, observamos un solo pico de masa de alta intensidad, correspondiente a m/z 4114,8 y 4163,8, respectivamente, que tras la reducción y la alquilación se desplazaron por una diferencia de masa de 348 Da indicativa de la modificación de 3 disulfuro interno enlaces que existen en estos péptidos. Los péptidos no modificados, m/z 4114 y 4163, y sus derivados carbamidometilados (CAM) se purificaron mediante HPLC de fase inversa. Utilizando los péptidos purificados, determinamos sus secuencias parciales mediante digestión con tripsina seguida de MALDI-TOF-MS, MALDI LIFT-TOF/TOF y degradación de Edman que mostró sus homologías inequívocas con otros AvBD2. Combinando todos los resultados y alineando los tramos de secuencia con AvBD2 maduro de otras especies de aves, deducimos las secuencias de aminoácidos de los ortólogos de faisán y codorniz como LFCKRGSCHFGRCPSHLIKVGSCFGFRSCCKWPWNA y LFCRRGTCHFGNCPSDQIKVGNCFGFRSCCRWPWDA, respectivamente. Esta información de secuencia se confirmó aún más mediante análisis de descomposición en fuente (ISD) de MALDI. Tanto los péptidos AvBD2 de faisán como los de codorniz mostraron identidades significativas (>80 %) con otras secuencias conocidas de AvBD2.