Revista de Proteómica y Bioinformática

Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

ISSN: 0974-276X

abstracto

Modelado de homología y acoplamiento a un nuevo inhibidor potencial para la proteína nsP2 proteasa de chikungunya (37997)

Limpón Bora

La chikungunya es una enfermedad viral que se transmite a los seres humanos a través de la picadura de un mosquito. Chikungunya puede causar fiebre, escalofríos, náuseas, vómitos, dolor en las articulaciones, dolor de cabeza e inflamación en las articulaciones. Una causa de Chikungunya se debe principalmente a la replicación del virus Chikungunya en el cuerpo humano. La proteína nsP2 (Proteína 2 no estructural) es responsable de la replicación del virus Chikungunya. La replicación de CHIKV provoca el apagado general del host. La replicación de CHIKV es resistente a la inhibición por interferón una vez que se ha establecido la replicación de ARN y que CHIKV suprime activamente la respuesta de IFN antiviral al prevenir la expresión génica inducida por IFN. La replicación y propagación del virus Chikungunya depende de la actividad proteasa de la proteína viral nsP2, que escinde el complejo de replicación de la poliproteína nsP1234 en una unidad funcional. Este estudio investiga la proteína proteasa nsP2 de Chikungunya 37997 y se han utilizado métodos computacionales para encontrar el mejor sitio de interacción. en la proteína proteasa e identificar los mejores compuestos de ligando para inhibir la proteína nsP2. El modelado de homología se utilizó para predecir la estructura tridimensional de la proteína proteasa nsP2. La estructura 3D se validó utilizando el Servidor de Validación de Estructura (SAVS) en el que el 85,2% de los residuos presentes en las regiones favorecidas de la Parcela Ramachandran. Se llevaron a cabo estudios de acoplamiento con varios inhibidores y se encontró que LIGAND_4 (N-butil-9-[3,4-dipropoxi-5-(propoximetil)oxolan-2-il] purin-6-amina) tenía la interacción más estable con la proteasa CHIKV nsP2. Indica que LIGAND_4 podría ser un inhibidor prometedor para la proteasa nsP2 del virus CHIKV como diana farmacológica.

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