Investigación inmunológica
Acceso abierto
ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Chen Yanover, Effie W. Petersdorf, Mari Malkki, Ted Gooley, Stephen Spellman, Andrea Velardi, Pe-ter Bardy, Alejandro Madrigal, Jean-Denis Bignon, Philip Bradley
El éxito del trasplante de células hematopoyéticas de un donante no emparentado depende en parte del grado de antígeno leucocitario de histocompatibilidad humana (HLA) compatibilidad entre donante y paciente. Presentamos un análisis basado en la estructura del desajuste de HLA, centrándose en los desajustes de aminoácidos individuales y su efecto sobre la especificidad de unión de péptidos. Usando simulaciones de modelos moleculares de interacciones HLA-péptido, encontramos evidencia de que los desajustes de aminoácidos predichos para perturbar la especificidad de unión del péptido están asociados con un mayor riesgo de mortalidad en un conjunto de datos grande y diverso de pares de pacientes-donantes reunidos por el Grupo de Trabajo Internacional de Histocompatibilidad en el consorcio de trasplante de células hematopoyéticas. Este análisis puede representar un primer paso hacia la predicción basada en secuencias del riesgo relativo de desajustes de alelos HLA.