Revista de bioquímica y fisiología vegetal
Acceso abierto
ISSN: 2329-9029
ISSN: 2329-9029
Tariq Pervaiz1,2, Abolfazl Lotfi1, Muhammad Salman Haider1, Jia Haifang1 y Jinggui Fang1*
Las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento (HTS) se convirtieron en indispensables para la investigación genómica y el tema más candente reciente para la investigación en el campo de la genómica, que puede generar más de 100 veces más datos en comparación con los secuenciadores capilares más complicados. Los avances y desarrollos recientes en HTS utilizando técnicas de secuenciación de próxima generación se han vuelto esenciales en los estudios de perfiles de expresión génica digital, en epigenómica, genómica y transcriptómica. Estas metodologías son hábiles para secuenciar múltiples moléculas de ADN en correspondencia; facilitar la secuenciación de cientos de millones de moléculas de ADN en un corto período de tiempo. Sin embargo, los gastos y el período de tiempo se han reducido significativamente; los perfiles y límites inexactos de la nueva política difieren considerablemente de los de las técnicas de secuenciación informadas anteriormente. Los desarrollos técnicos y la disminución del costo de la tecnología NGS (Next Generation Sequencing) han hecho que la secuenciación de ARN (RNA-seq) sea una técnica popular en todo el mundo para proyectos de expresión génica. Se han realizado varios enfoques para la estandarización de los datos de secuenciación de ARN, que se han materializado en los informes, contradictorios, tanto en el tipo de modificación del sesgo como en el enfoque estadístico. Por otro lado, a medida que los datos se acumulan de manera persistente, no ha habido un consenso aparente sobre las técnicas de normalización adecuadas que se utilizarán o el impacto de los métodos elegidos en el análisis posterior. En el presente artículo, mencionamos las características clave de HT-NGS como, las plataformas Key HTS y diferentes aplicaciones de secuenciación, limitación ética y prospectiva futura.