Revista de química física y biofísica
Acceso abierto
ISSN: 2161-0398
ISSN: 2161-0398
Diana J Uribe, Yoon-Joo Shin, Eric Lau, Scot W Ebbinghaus y Daekyu Sun
El promotor proximal del gen del factor 1 alfa inducible por hipoxia (HIF-1α) contiene un tracto de polipurina/polipirimidina (pPu/pPy), que se ha demostrado que afecta el 90% de su control transcripcional. Se sabe que la secuencia rica en guanina de este tracto pPu/pPy es estructuralmente dinámica, formando fácilmente una estructura G-cuádruplex con un patrón de plegamiento 1:6:1. En el presente estudio, demostramos que la secuencia rica en citosina (rica en C) dentro del tracto pPu/pPy del HIF-1α; El promotor es capaz de formar dos estructuras i-motif intramoleculares principales con patrones de plegamiento 3:3:3 o 3:4:2 cerca del pH fisiológico utilizando dicroísmo circular, huella de bromo y análisis mutacional dirigido al sitio. Estas estructuras son los primeros i-motifs conocidos que se forman a pH neutro, con un pH de transición de 6,9, que se ha descubierto que se forman dentro de la secuencia promotora proximal de los oncogenes. Además, los ensayos de cambio de movilidad electroforética (EMSA) combinados con la huella de bromo revelaron que la ribonucleoproteína K nuclear heterogénea (hnRNP K) puede unirse al estado desplegado de la secuencia rica en C de una manera específica de secuencia. En conjunto, nuestros resultados demuestran que las estructuras i-motif que se forman dentro de la secuencia rica en C de HIF-1α; promotor puede formarse en condiciones fisiológicas y que hnRNP K puede unirse a esta secuencia rica en C.