Revista internacional de minería de datos biomédicos

Revista internacional de minería de datos biomédicos
Acceso abierto

ISSN: 2090-4924

abstracto

Glicopéptidos por química cuántica e inteligencia artificial

Mehmet Gokhan Habiboglu

La glicación destruye o altera la función biológica de péptidos y proteínas. Los polímeros de la pared celular de las bacterias consisten en GlcNAc, que se entrecruza con oligopéptidos. Si bien la glutamina es un aminoácido no esencial que puede derivarse de la glucosa, algunas células cancerosas dependen principalmente de la glutamina para su crecimiento, proliferación y supervivencia. Numerosos tipos de cáncer también dependen de la asparagina para la proliferación celular. Por lo tanto, las interacciones de la glucosa y la asparagina están en el centro del cáncer. Además, el virus Semliki Forest cultivado en células de mosquito consta de oligosacáridos unidos a asparagina. La proteína de la cubierta del virus del dengue (E) consta de dos sitios de glicosilación unidos a N, asparagina-67 y asparagina-153. Las cadenas laterales de oligosacáridos unidos a N en las proteínas E de los flavivirus se han asociado con la morfogénesis viral, la infectividad y el tropismo. Desde el punto de vista virológico, el ZIKV consiste en un ARN monocatenario de sentido positivo, mientras que el genoma codifica tres proteínas estructurales, incluida una proteína E. Tanto la criomicroscopía electrónica como las mediciones de cristalización respaldaron el papel de la asparagina como sitio de glicosilación para la unión de la célula huésped. Estudios recientes han demostrado que ZIKV ataca partes del cerebro adulto que son fundamentales para el aprendizaje y la memoria. Además, un cambio observable en el cerebro es el deterioro del metabolismo de la glucosa dentro de la progresión de la enfermedad de Alzheimer, evaluado mediante tomografía por emisión de positrones para controlar la captación de {18F}-2-desoxi-2-fluoro-glucosa en el cerebro de pacientes con enfermedad de Alzheimer. El mecanismo molecular exacto entre O-GlcNAc y Aβ sigue siendo difícil de alcanzar a nivel atómico. Aquí, presentamos las estructuras y la energía de los complejos Glc-Asn y GlcNAc-Asn en un medio de solución acuosa a nivel electrónico utilizando cálculos químicos cuánticos vinculados con estudios de inteligencia artificial.
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