Revista de glucómica y lipidómica
Acceso abierto

abstracto

Glycomics se vuelve visual e interactivo

Alessandra Gastaldello

Glycomics@ExPASy la pestaña de glucómica del servidor del Instituto Suizo de Bioinformática (www.expasy.org/glycomics) se creó en 2016 para centralizar los recursos de glucoinformática basados en la web desarrollados dentro de una red internacional de glicocientíficos. La filosofía de esta caja de herramientas es ser amigable con los {glucocientíficos Y científicos de proteínas} con el objetivo de popularizar (a) el uso de la bioinformática en glicobiología y (b) la relación entre la glicobiología y los recursos bioinformáticos orientados a proteínas. La escasez de datos puente nos llevó a diseñar herramientas lo más interactivas posible basadas en la conectividad de la base de datos para facilitar la exploración de datos y apoyar la construcción de hipótesis. El conjunto actual de recursos se basa principalmente en datos curados o experimentales relativos a estructuras de glicanos, glicoproteínas, interacciones huésped-patógeno y datos de espectrometría de masas. La información se proporciona al usuario con servicios dedicados integrados en aplicaciones web. Las herramientas de consulta admiten consultas de composición, subestructura y epítopos para hacer coincidir estructuras y características relacionadas. Esta presentación cubrirá la última versión de Glycomics@ExPASy y se centrará en las herramientas recientemente desarrolladas, la mayoría de las cuales son visuales e interactivas