Revista de glucómica y lipidómica
Acceso abierto
ISSN: 2153-0637
ISSN: 2153-0637
Guo Jun Yang
Los elementos transponibles repetidos invertidos en miniatura (MITE) son elementos transponibles (TE) interesantes debido a su alto número de copias e identificaciones misteriosas. A pesar de su bajo porcentaje de contenido de ADN en un genoma, sus numerosas copias pueden alterar la estabilidad genómica y causar importantes variaciones genéticas. Históricamente, las familias MITE a menudo se descubrían individualmente, una práctica que no puede seguir el ritmo de la secuenciación del genoma a gran escala. Es deseable el descubrimiento automatizado de todo el genoma de las familias de MITE y su caracterización. Desarrollamos una tubería completa desde el descubrimiento de MITE hasta análisis detallados de MITE a escala genómica. Usando la canalización, realizamos análisis en profundidad de las familias de MITE en múltiples genomas de cultivos lanzados recientemente. Estos análisis revelaron la diversidad de familias de MITE y su evolución en el genoma del huésped. También hemos predicho las transposasas que pueden ser responsables de la movilización de algunas familias de MITE. Estas familias de MITE pueden utilizarse potencialmente como marcadores genéticos para la mejora de estas especies de cultivos.