Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Estado de metilación genómica para la discriminación entre especies de Helicobacter: un enfoque bioinformático

Filipa F. Vale y Jorge M. B. Vítor

El género Helicobacter comprende varias especies de bacterias intestinales tanto gástricas como enterohepáticas. H. pylori, la especie tipo del género, está asociada con gastritis, úlcera péptica y cáncer gástrico en humanos. El genoma de H. pylori tiene una gran cantidad de sistemas de restricción y modificación (R-M) y su diversidad es útil para la tipificación de cepas. Para analizar si un número tan alto de metiltransferasas expresadas es una característica del género Helicobacter, la metilación genómica de cinco Helicobacter spp no pylori. (H. canadensis, H. canis, H. felis, H. mustelae y H. pullorum). Los resultados revelaron que el número de sistemas R-M entre Helicobacter spp. es menor que los observados entre un grupo de 221 cepas de H. pylori (p<0,001), pero es mayor que los observados para la media de todos los genomas bacterianos secuenciados (p=0,005). Análisis de ARN ribosomal 16S de cepas secuenciadas de H. pylori y cinco Helicobacter spp no pylori. aislar claramente la especie H. pylori. Sorprendentemente, el análisis del estado de metilación genómica por el algoritmo MCRM se realiza de manera similar. Esto sugiere que los sistemas R-M no parecen propagarse de manera miscelánea, una vez que incluso estos genes pueden estar sujetos a adquisición y pérdida; su expresión aún permite discriminar entre Helicobacter spp.