Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Identificación y caracterización de las familias de genes en todo el genoma Control de la biosíntesis de ácidos grasos en la linaza (Linum usitatissimum L)

Frank M You, Pingchuan Li, Santosh Kumar, Raja Ragupathy, Zhengnan Li, Yong-Bi Fu y Sylvie Cloutier

La linaza (Linum usitatissimum L.) es un cultivo importante con muchas características, como sus abundantes ácidos grasos omega-3 esenciales para la nutrición humana. La biosíntesis de ácidos grasos (FA) en plantas, incluido el lino, implica varios pasos consecutivos regidos por diferentes familias de genes. Utilizando la extracción de genes in silico y el análisis comparativo, se llevó a cabo la identificación y caracterización de genes de todo el genoma para seis familias de genes relacionadas con la biosíntesis de AF, incluidos KAS, SAD, FAD, KCS y FAT. Identificamos 91 genes relacionados con AF de lino cv. Genoma CDC Bethune, a partir del cual se validaron siete genes previamente clonados. Los 84 genes relacionados con FA recientemente identificados incluyen 14 genes nuevos de la familia KAS, dos de la familia SAD, 13 de la familia FAD2, tres de la familia FAD3, 38 de la familia KCS y 14 de la familia FAT. De los 91 genes identificados, 88 se duplicaron como consecuencia de eventos recientes de duplicación del genoma completo, en los que se planteó la hipótesis de que 13 genes FAD2 evolucionaron a partir de eventos de duplicación de genes en tándem seguidos de un evento de duplicación del genoma completo y, más recientemente, de un solo eliminación de genes. Las seis familias de genes descritas aquí están muy conservadas en las plantas y han divergido en la antigüedad. Estos genes de lino recientemente identificados serán un recurso útil para futuras investigaciones sobre la clonación y expresión de genes FA, la identificación de QTL, el desarrollo de marcadores y la selección asistida por marcadores.