Investigación inmunológica
Acceso abierto

abstracto

Regulación genética de gelsolina en pulmón en modelo de ratón y su potencial Amplio espectro de funciones biológicas

Xiaoyun Liu, Helin Feng, Jiaqian Zhu, Rachel Stein, Yue Huang, Yan Jiao y Xiaodong Zhu

Se han realizado estudios considerables sobre la posible función biológica de la gelsolina y su conexión con el sistema inmunitario humano, enfermedades y otros trastornos. El objetivo de nuestro estudio fue identificar los factores genéticos que regulan la gelsolina en pulmón de ratón y analizar su función en el sistema inmunitario utilizando cepas endogámicas recombinantes bien definidas. Para este propósito, elegimos las cepas consanguíneas recombinantes (RI) BXD derivadas de la progenie de las cepas progenitoras C57BL/6J (B6) y DBA/2J (D2). Se usó la expresión génica del genoma completo en pulmón para el mapeo de eQTL. Se utilizaron herramientas bioinformáticas y datos de genotipado para el análisis de genes candidatos. Se utilizaron procesos de red y correlación de genes para evaluar la asociación entre la gelsolina y los rasgos biológicos. Los datos indicaron que un eQTL en el cromosoma 9 que cubre un área genómica entre 21 Mb y 30 Mb es un factor importante en la regulación del nivel de expresión de gelsolina. El análisis de elementos genéticos dentro de esta región reveló que Ncapd3 es el gen candidato más favorito. Su nivel de expresión está muy asociado al de la gelsolina. El nivel de expresión de gelsolina entre cepas de ratón con dos genotipos de SNP (rs13480109) en una región reguladora de Ncapd3 mostró una diferencia significativa. Análisis de asociación adicionales sugieren que la gelsolina puede tener un amplio espectro de funciones biológicas. El nivel de expresión de gelsolina tiene una correlación muy alta con genes en una variedad de funciones biológicas. Estos genes altamente asociados son principalmente para la unión a proteínas. La expresión de gelsolina también se correlaciona con múltiples fenotipos inmunitarios conocidos. Estos datos contribuyen significativamente a nuestro conocimiento actual sobre la función biológica de la gelsolina.