Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Perfil de expresión génica de la meningitis tuberculosa

Ghantasala S. Sameer Kumar, Abhilash K. Venugopal, Lakshmi Dhevi N. Selvan, Arivusudar Marimuthu, Shivakumar Keerthikumar, Swapnali Pathare, Jyoti Bajpai Dikshit, Pramila Tata, Ramesh Hariharan, Thottethodi Subrahmanya Keshava Prasad, H. C. Harsha, Y.L Ramachandra, Anita Mahadevan, Raghothama Chaerkady, S. K. Shankar y Akhilesh Pandey

La meningitis tuberculosa (TBM) es una forma de tuberculosis extrapulmonar que se asocia con déficits neurológicos graves y una alta mortalidad. El diagnóstico precoz de TBM es un desafío importante a pesar de la disponibilidad de varios métodos de diagnóstico. Los métodos y marcadores de diagnóstico existentes son inadecuados para el diagnóstico precoz de la TBM debido a su baja especificidad y sensibilidad. La tecnología de micromatrices de ADN permite la identificación de alto rendimiento de genes expresados diferencialmente. Con el fin de identificar moléculas como biomarcadores candidatos para el diagnóstico precoz o como dianas terapéuticas en TBM, llevamos a cabo un análisis transcriptómico del tejido cerebral utilizando matrices de oligonucleótidos del genoma humano completo. A partir de este análisis de expresión génica, identificamos 2434 genes que se expresaron diferencialmente al menos dos veces en los casos de TBM en comparación con los controles. La gran mayoría de los genes expresados diferencialmente codifican proteínas que están implicadas en el metabolismo, el crecimiento celular, el transporte, la respuesta inmunitaria, la comunicación celular y la transducción de señales. Confirmamos la regulación positiva de dos moléculas, el inhibidor de la serpina peptidasa, miembro 3 del clado A (SERPINA3) y la proteína ácida fibrilar glial (GFAP), a nivel de proteína mediante análisis inmunohistoquímico. Los hallazgos de nuestro estudio deberían ayudarnos a comprender los mecanismos moleculares subyacentes a la TBM y a desarrollar mejores estrategias diagnósticas y terapéuticas contra esta enfermedad mortal.